1.α-干擾素(α-IFN)
治療慢性丙型肝炎有一定療效。治療後血清HCVRNA轉陰率可達50%～80%，但停藥後約半數HCVRNA又轉陽，再用α-干擾素仍有效。在HCV復制指標轉陰同時可見肝功能改善及肝髒病變好轉。提示干擾素對HCV有抑制作用，但不能完全清除病毒。復發時間多在治後6～12個月，若治後12個月ALT持續正常，血清HCVRNA陰性，則可能治愈。
2.三氮唑核苷(rilavirin，病毒唑)
為一廣譜抗病毒藥，治療慢性丙型肝炎療效不如干擾素。對血清和肝HCV-RNA無明顯降低作用。
3.干擾素(interferon，IFN)治療
IFN治療輸血後慢性丙型肝炎的持久應答率為25%，可防止30%的急性丙肝向慢性化發展，到目前為止，IFN仍是公認的治療丙型肝炎病毒的藥物。Omata報道，輸血後丙肝1年後ALT恢復正常者，IFN治療組為64%，對照組為7%，輸血後3年HCVRNA陰性者，IFN治療組為90%，對照組為0%。一般認為，HCV感染時間越短，肝組織學病變越輕，血中病毒水平越低則療效越好。因此對急性丙型肝炎，血ALT持續不降者，應考慮IFN抗病毒治療。
4.利巴韋林(三氮唑核苷，Virazole，Ribavirin)
當前國內外學者多數認為利巴韋林治療慢性丙型肝炎，在改善肝功能，抗病毒方面顯示一定療效，但這種作用停藥後不能維持，可與IFN或免疫調節劑並用，以提高療效。
5.肝移植
慢性丙型肝炎晚期可用肝移植治療。但新移植的肝常發生HCV感染，系由肝外HCV傳入所致，也可發生急性重型肝炎。
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