本病一般起病緩慢，僅少數短期內重度感染的患者臨床上表現為急性發病。輕度感染者常無症狀或僅在食後有上腹部飽脹感、食欲缺乏或輕度腹痛。患者易疲勞。糞便中可檢出蟲卵。較重感染者通常起病較慢，有食欲缺乏、上腹飽脹、輕度腹瀉、肝區隱痛。24%～96.3%的患者有肝大，以左葉為明顯，有壓痛和叩擊痛。可伴有頭暈、失眠、疲乏、精神不振、心悸、記憶力減退等神經衰弱症狀。
個別患者因大量成蟲堵塞膽總管而出現梗阻性黃疸，甚至發生膽絞痛。慢性重復感染的嚴重病例發展為肝硬化及門脈高壓時，出現消瘦、貧血、腹壁靜脈曲張、肝脾大、腹水、黃疸等。嚴重感染的兒童可出現營養不良和生長發育障礙，甚至可引起侏儒症。嚴重感染者常可呈現急性起病。潛伏期短，僅15～26天。患者突發寒戰及高熱達 39℃以上，呈弛張熱。食欲缺乏、厭油膩食物、肝大伴壓痛，有輕度黃疸，少數出現脾大。數周後急性症狀消失而進入慢性期，表現為疲乏、消化不良、肝大伴壓痛等。
華支睾吸蟲病症狀輕重不等，一般可將其分為三度：①輕度可無自覺症狀，只在糞便檢查時才發現蟲卵者。或有輕度胃腸道症狀，如食後胃部有壓痛感，軟便等。約占35%。②中度主要有較明顯胃腸道症狀，如食欲缺乏、消化不良、右上腹脹痛，肝大，輕度水腫。如並發細菌感染可繼發膽管炎、膽囊炎。約占55%。③重度有明顯胃腸症狀，反復腹瀉或便秘，右上腹疼痛或有脾大、腹水、貧血等。多見於兒童，約占10%。
同一患者可有上述臨床類型中幾種同時存在。此外，尚有極少數來自非流行區，初次大量感染的患者，於感染後1個月左右可突然發病，呈寒戰、高熱，中上腹或右上腹脹痛，肝大伴壓痛，輕度黃疸，亦有脾腫大者。血中嗜酸性粒細胞顯著增高。極個別患者出現類白血病反應。數周後急性症狀消失而仍有消化不良、乏力、肝大等表現。
