肝硬化往往因並發症而死亡，晚期肝硬化可能出現並發症如下：
1.肝性腦病：肝性腦病是最常見的死亡原因。
2.上消化道大量出血：肝硬化上消化道出血，大多數是由於食管-胃底靜脈曲張破裂，但還應考慮其他因素如並發消化性潰瘍、門脈高壓性胃病、急性出血糜爛性胃炎、贲門黏膜撕裂綜合征等。靜脈曲張破裂出血可因粗糙食物、化學性刺激及腹內壓增高等因素而引起，常表現為嘔血與黑糞。若出血量不多，可僅有黑便。大量出血則可致休克，並誘發腹水和肝性腦病，甚至死亡。出血後原來腫大的脾髒可縮小，甚至不能觸及。
3.感染：肝硬化患者由於脾功能亢進，機體免疫功能減退而抵抗力降低，以及門體靜脈間側支循環的建立，增加了病原微生物進入人體的機會，故易並發各種感染如支氣管炎、肺炎、結核性腹膜炎、膽道感染、自發性腹膜炎及革蘭陰性桿菌敗血症等。自發性腹膜炎是指肝硬化患者腹腔內無髒器穿孔的腹膜急性細菌性感染，發生率可占肝硬化的3%-10%。其原因為肝硬化時單核-吞噬細胞的噬菌作用減弱，腸道內細菌異常繁殖，細菌通過腸壁進入腹腔；肝內外血管結構改變，細菌可通過側支循環，引起菌血症或帶菌的淋巴液自肝包膜下與肝門淋巴叢漏入腹腔而引起感染。典型病例有發熱、腹痛與腹壁壓痛和反跳痛，白細胞可有增高，腹水混濁，呈滲出液。腹水培養可有細菌生長，鲎溶解物試驗常陽性。少數病例無腹痛或發熱，表現為低血壓或休克，頑固性腹水或進行性肝功能衰竭。
4.原發性肝癌：原發性肝癌多發生在肝硬化的基礎上，有下列情況時應考慮並發肝癌的可能性。①在積極治療下，病情仍迅速發展與惡化。②進行性肝腫大。③無其他原因可解釋的肝區痛。④血性腹水的出現。⑤無其他原因可解釋的發熱。⑥甲胎蛋白持續性或進行增高。⑦B型超聲或放射性核素肝掃描檢查發現占位性病變。
5.肝腎綜合征：肝硬化並發頑固性腹水且未獲恰當治療時可出現肝腎綜合征。其特征為少尿或無尿、氮質血症、低血鈉與低尿鈉。腎髒無器質性病變故亦稱功能性腎功能衰竭。其發病與下列因素有關：①大量腹水時因進食減少、嘔吐、腹瀉、利尿劑應用不當，使循環血容量減低，腎髒有效血容量減少，腎小球濾過率及腎血漿流量下降。②肝功能衰竭時，肝髒對血液中有毒物質清除力減弱，加重了腎的損害。此並發症在臨床上並不少見，預後極差。功能性腎功能衰竭的持續存在和發展，也可導致腎髒的實質性損害，而致急性腎功能衰竭。
6.門靜脈血栓形成：約10%結節性肝硬化可並發門靜脈血栓形成。血栓形成與門靜脈梗阻時門靜脈內血流緩慢、門靜脈硬化、門靜脈內膜炎等因素有關。如血栓緩慢形成，局限於肝外門靜脈，且有機化，或側支循環豐富，則可無明顯臨床症狀。如突然產生完全性梗阻，可出現劇烈腹痛、腹脹、便血、嘔血、休克等。此外，脾髒常迅速增大，腹水加速形成，並常誘發肝性腦病。
7.晚期肝硬化的愈後效果取決於病人的營養狀況、有無腹水、有無肝性腦病、血清膽紅素和白蛋白水平以及凝血酶原時間。還與病因、年齡和性別有關。一般說來，病毒性肝炎引起的肝硬化預後較差；年齡大者，男性預後較差。如再出現肝腎綜合征、肝性腦病、並發食管靜脈大出血、嚴重感染等則病情危重，預後極差。
