既往很少對肝硬化病人評估干擾素抗病毒治療，這是由於肝硬化病人使用干擾素的效益/風險比（benefit/risk ratio）太低，即效益比較低，又擔心出現副作用。所以，一般均將肝硬化病人排除在治療之外。但是，隨著對干擾素治療效果和有關副作用見解的知識積累，國外專家認為，對於代償良好的肝硬化患者，通過干擾素治療，可進一步清除殘存病毒，使肝功能更趨於穩定，肝硬化患者用干擾素抗病毒治療是有效的，是可行的。
但必須掌握好適應症，以下幾點條件供參考：
（1）肝功能代償較好。與慢性乙肝、丙肝適應症相同，血清膽紅素<34。2mol/L，ALT在正常值2～10倍之間；
（2）病毒指標提示病毒正在活動：乙型肝炎後肝硬化患者HBeAg陽性，HBV DNA陽性（用斑點雜交法檢測）；丙型肝炎後肝硬化HCV RNA陽性者；
（3）無出血傾向，血小板不低於70×10的9次方/L
（4）年齡小於65歲，無其他並發症和並存症者；
（5）治療過程中，需密切觀察不良反應的發生並及時處理。
並且，國外已有在肝硬化肝移植中進行抗病毒治療的報道。
