一、如果乙肝治療不當就會破壞人體的免疫系統，這樣會給患者帶來嚴重的危害。這是因為人體在感染乙肝病毒後，人體的免疫系統會與病毒之間進行長期的爭斗，若治療不對症，很可能會損傷人體的免疫。這樣到最後會使患者處於無免疫應答或免疫應答低的狀態，會對患者的治療帶來很大的困難。
二、由於目前治療乙肝沒有特效藥，所以患者在治療乙肝的過程中病情很容易慢性化。這樣就需要的治療時間比較長，會影響患者的學習和工作。如果有的患者沒有及時的進行治療或者治療方法不當，就會加重對肝髒的損傷，導致病情越來越嚴重，可發展為肝硬化或肝癌而死亡。
三、乙肝治療不當會導致乙肝病毒變異以及產生耐藥性。這是因為乙肝病毒生命力異常頑強，如果治療不當就會導致乙肝病毒出現變異。而乙肝病毒一旦發生變異，人體的免疫系統就分辨不出了，繼而產生免疫耐受，這樣就無法全面徹底地清除乙肝病毒。
從上面的描述來看，乙肝治療不當對患者造成的危害非常大，所以乙肝患者在開始治療的時候就要選擇正規的醫院，接受專業的針對性治療，避免因為治療不當而出現的危害。
