按食品的相對營養價（RNV），以當量為單位計算，菌藻類食物中含有較高蛋白質及維生素B類及E，微量元素也十分豐富。在食用菇類裡，以干口蘑中蛋白質最高約55.3，其次RNV蛋白質量在20以上的有大紅菇、松蘑、香菇（干）、冬菇、黃蘑、羊肚菌、普大香杏、普中紅蘑、珍珠白蘑等。
藻類中發菜、紫菜中蛋白質含量高。含維生素B2最高的是大紅菇，其次有松蘑、香杏片、干冬菇、羊肚菌、普大香杏、香菇等。口蘑、大紅菇、干冬菇、干香菇、干蘑菇中尼克酸的營養價均在170以上。維生素E則以發菜、海凍菜、黑木耳中最高。含鐵量最高的是苔菜、普中紅蘑、珍珠白蘑等。含硒量最高的是干香菇、普中紅蘑、珍珠白蘑。含鉀量最高的是口蘑。含鈣量最高的是發菜。含磷量最高的是苔菜。含錳量最高的是黑木耳、地衣等。總之菌藻類是老少婦嬰皆宜的理想保健食品。
根據中醫的認識，菌藻類是良好的食療佳品。如：
香菇又名冬菇，味甘性平，有補氣養肝益胃，脫痘毒之功。可調治體虛食少、小便頻數、小兒體虛痘疹干癟難出，並能增強免疫功能。對各種肝病、高血壓、動脈硬化、糖尿病、腫瘤病人均食之有益。
蘑菇味甘性涼，有補益胃腸，化痰理氣之功。對小兒麻疹透發不快，急慢性肝炎均有食療好處。
銀耳又名白木耳，味甘淡性平，有養陰潤肺，益胃生津之功。可調治虛勞咳嗽、痰中帶血、衄血、咯血、便秘、高血壓、血管硬化症等。有利於脂肪肝患者的中性脂肪從體內移除。
木耳又稱黑木耳，味甘淡性平，有潤燥利腸、滋腎護肝、涼血止血、活血化瘀之功。可調治痔瘘、便血、尿血、崩漏、高血壓、便秘等，還有提高白蛋白和清除胃腸道垃圾之功。
發菜又名龍須菜，味甘性寒，有清熱利小便，軟堅散結化痰之功。可調治內熱諸症、急慢性肝炎、脂肪肝、瘿瘤結氣（甲狀腺腫大）、肝炎後肝硬化（抗纖維化）、小便不利、高血壓、腎病等。
紫菜味甘鹹性寒，有清熱利水、有軟堅化痰、利水、化痰軟堅之功。可調治甲狀腺腫、瘰疬、咳嗽吐臭痰、肝硬化、水腫、小便不利等。
海帶味鹹性寒，有軟堅化痰、利水洩熱之功。調治瘰疬、瘿瘤、疝氣、水腫有一定作用。
海藻味鹹性寒，有軟堅散結、清熱利水之功。調治早期肝硬化、瘰疬、瘿瘤、高血壓、動脈硬化、疝氣均有一定效果。
食用菌藻類，經現代醫學研究可明顯提高人體免疫力，對脂肪肝性肝病，應該是每天都必需選吃的保健食品佳品
