我們通常所說的肝癌一般是指各種原因引起的原發於肝髒的肝細胞癌。乙型肝炎病毒與肝癌的關系最為密切，肝癌患者中有75 ％乙型肝炎病毒表面抗原呈陽性，乙型肝炎病毒是原發性肝癌的主要病因。
應用聚合酶鏈反應可在肝細胞癌與癌周圍組織中檢出丙型肝炎病毒核糖核酸，說明丙型肝炎病毒與肝癌有關系，有報道說丙型肝炎與乙型肝炎的重疊感染可增加發展到肝癌的機會。
丙型肝炎病毒之所以能夠導致肝癌的發生，可能是丙型肝炎病毒有直接致癌作用，也可能是丙型肝炎病毒促使肝硬化的發生，肝硬化又進一步發展到肝癌。其真正的機理目前正在研究中。
