肝囊腫是一種肝髒良性病變，短期不會對肝功能造成影響，而且生長速度極慢，對患者沒有什麼大的威脅，一般不需要處理。但是對於以下四種肝囊腫，則應該及早治療。肝囊腫扭轉：肝囊腫扭轉並不常見，但是當懸垂型肝囊腫發生扭轉時，患者會出現劇烈腹痛，手術可能是唯一的治療方法。此現象甚為罕見。
巨大肝囊腫：少數肝囊腫生長速度較快，當囊腫直徑超過10厘米時，醫學上稱之為巨大肝囊腫。巨大肝囊腫容易引起壓迫症狀，會影響患者的生活和工作，應積極治療。
治療方法主要有兩種：
一是肝穿刺抽取液體，即在b超引導下，用細針將囊腫內的液體抽出，然後再注入酒精，使囊腫不再長大。
二是肝囊腫「揭頂」手術，即在吸淨囊液後，將大部分囊壁或所有游離的囊壁切除，就像將房頂揭掉一樣。此外，肝囊腫手術也可在腹腔鏡下進行。肝囊腫繼發感染：單純的肝囊腫症狀並不嚴重，但是當它繼發感染時，患者可有肝區疼痛、發熱、血白細胞升高等炎症表現，應及時進行抗感染治療。
肝囊腫繼發出血：出血主要是由於囊壁血管可自發破裂，導致的囊內出血。有的患者無明顯症狀，也有的患者會出現肝區劇烈疼痛，酷似急腹症。若保守治療無效，應進行手術治療
