慢性乙型、慢性丙型和慢性丁型肝炎均可引起肝硬化化。丁型肝炎病毒依賴乙型肝炎病毒進行復制和表達，因此其感染只發生於乙型肝炎病人中。乙型肝炎病毒是通過誘導機體的自身免疫對肝細胞造成損害，而慢性丙型肝炎和慢性丁型肝炎是病毒引起原發性肝細胞損害所致。
我國是乙型肝炎的高發區，乙型肝炎病毒攜帶者約占總人口的10％，目前有超過3000萬的乙型肝炎病人。其中HBeAg持續陽性的慢性乙型肝炎病人中，50%可發生肝硬化，HBeAb陽性的患者一般不發生肝硬化。肝硬化患者當病情發展到失代償期往往出現一個或多個嚴重的肝功能衰竭(肝衰) 和門靜脈高壓症的並發症， 如營養不良、低蛋白血症、凝血功能障礙、頑固性腹水、反復發生的食管胃底靜脈曲張破裂出血和肝性腦病、肝腎綜合症等。有40％的肝硬化病人終將病死於各種並發症，因此乙型肝炎後肝硬化失代償期行肝髒移植是我國最主要的適應證。由於乙型肝炎病毒常存在於肝細胞以外的其它細胞內，過去常困擾移植醫師和患者的問題是，患者在行肝髒移植術後常常出現移植肝乙型肝炎病毒（HBV）的再感染，導致肝炎的復發甚至移植肝功能喪失。如果術前HBeAg陽性或HBV-DNA陽性，在沒有任何預防措施的前提下，術後乙型肝炎復發率可以高達80%。因此早期移植效果均不甚理想。
近年來，由於乙型肝炎免疫球蛋白（HBIG）和拉米夫定的預防性應用，肝髒移植術後HBV再感染率顯著下降，其患者的生存期和其他類型的患者也不相上下。HBIG是第一個被臨床證實有效的預防肝髒移植術後HBV再感染的藥物，但其作用具有明顯的量效關系，只有在肝髒移植術後長期大量使用HBIG超過6個月，才能使肝髒移植術後2年內HBV的平均再感染降低至10%，從而延長移植肝的存活期。長期應用HBIG也會使10%～20%的患者出現HBsAg編碼區的基因突變，導致HBIG和HBsAg結合的親和力下降而出現耐藥。單獨拉米夫定也可以使肝髒移植術後1年內HBV再感染率降低至20%，與長期應用HBIG的治療效果基本相當，主要問題是拉米夫定可誘導HBV聚合酶編碼區的YMDD變異，引起乙型肝炎病毒變異株的復發。因此許多學者認為HBIG和拉米夫定聯合用藥是預防HBV再感染的最佳方案，經驗證明可將再感染率控制在10％以下。恩替卡韋是目前抗HBV最有效的藥物，它既可以治療應用拉米夫定後引起的HBV再感染，也可以作為一線藥物應用以預防肝髒移植術後HBV再感染。
丙型肝炎後肝硬化的病人，病情進展到終末期，同樣需依靠肝移植來挽救生命，術後的10年存活率可達62%。丙型肝炎在術後也可以復發，復發率在20%左右，其中有12%-16%的病人僅為丙型肝炎病毒攜帶者而沒有任何臨床症狀和化驗異常，60%-70%的病人僅有輕度的化驗異常而沒有任何臨床症狀，4%-27%病人可以出現各種程度的臨床症狀，但只是8%-10%的病人會在10年之內發展成肝硬化需要再次肝移植。丙型肝炎以HCV1b型病毒復發率最高，但5年生存率與無感染組相比無明顯差異。
