在感染甲型肝炎後的2～3周內，有80%的患者體內會自然產生甲肝抗體(抗-HA)，病後2～3個月抗體達到高峰。甲肝抗體能抵御甲肝病毒對人體的損害。這種免疫力一般可維持較長的時間。格陵蘭1943年曾發生過一起甲肝大流行。在20多年之後的1970年至1974年之間，此地再次發生此病流行時，醫學專家們在血清學調查中發現，1943年以前出生者中，有93%的人抗-HA為陽性，其甲肝發病率僅為2.7%;1943年以後出生者中，僅有3%的人對甲肝具有免疫力，其甲肝發病率則高達21.4%。
雖然患過甲肝後可以獲取比較持久的免疫力，但這種免疫力並不是“終身制”，會受到個體因素(身體素質、疾病、勞動強度)和環境因素影響。隨著年齡增大，體質下降，對甲肝的免疫力也隨之下降。如果這種免疫力無法抵御一次性大量的甲肝病毒，人仍然可能再次患上甲肝。此時如果因曾患過甲肝而掉以輕心或未及時治療，則有可能增加病毒對肝髒功能的損害程度，有的甚至轉成慢性肝炎或肝硬化等疾病。
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