肝炎的治療是很多患者都非常關注的問題，自身免疫性肝炎也是一種比較多見的肝炎種類，對於兒童、合並病毒性肝炎、妊娠期及產後等特殊患者來說，除了要進行專業的治療，還應該重視很多問題。
兒童患者：自身免疫性肝炎需長期治療，兒童患者需根據臨床症狀和實驗室指標調整，推薦聯用硫唑嘌呤以減少皮質類固醇激素用量，治療失敗的兒童應使用大劑量皮質類固醇激素治療或考慮行肝移植術。
合並病毒性肝炎患者：病毒性肝炎患者常應用抗病毒藥物或皮質類固醇激素進行治療，抗病毒藥物會使肝炎惡化或引發其他自身免疫病，皮質類固醇激素同樣會加快肝炎病毒復制速度，初始治療以自身免疫性肝炎為主。
妊娠期及產後患者：自身免疫性肝炎患者生育能力降低，但只要孕婦維持強的松治療，妊娠仍可繼續,但流產率較正常人群高，胎兒可能早產但發育正常，皮質類固醇激素和硫唑嘌呤可用於妊娠期患者治療，雖有潛在風險，但撤藥後所致病情惡化會造成更大影響，因此妊娠期至產後數月均應嚴密監測。
肝炎不是不治之症，但是肝炎也不是容易治愈的疾病，患者還應該引起足夠的重視。在治療肝炎的同時，患者還應該樹立治愈疾病的信心，杜絕肝炎疾病的傳染，才能夠有效地控制肝炎疾病。
