實驗室檢查發現程度不同的膽紅素增高（主要是直接膽紅素），血清丙氨酸轉肽酶、天冬氨酸轉肽酶和r-谷氨酰轉肽酶活性顯著升高，以及血清鹼性磷酸酶輕微升高。轉氨酶升高的程度並不與肝髒損害的程度相關。
1、特異性抗體檢測：抗HEV，即戊型肝炎抗體，包括抗HEV-IgM和IgG。在急性期血清中可測出高滴度的抗HEV-IgM，恢復期抗HEV-IgM滴度下降或消失，取而代之的是血清中產生抗HEV-IgG。國內大多數醫院目前均使用酶聯免疫法（ELISA）檢測特異性抗體，其測定抗HEV-IgM最有臨床意義，為確診急性戊型肝炎的指標。應用酶聯免疫試驗（ELISA）檢測實驗感染的動物血清抗-HEV，提示感染後2～6周抗-HEV陽轉，3～4周達高峰，6周後降至低水平，病後5～6月63%轉陰。
2、免疫電鏡技術（IEM）和免疫熒光法（IF）：用以檢測戊肝患者糞便、膽汁和肝組織中HEV顆粒和HEV抗原（HEAg）。但此兩種方法均需特殊設備和技術，且HEV在肝組織、膽汁和糞便中存在時間較短，陽性率較低，不宜作為常規檢查。
3、逆轉錄聚合酶鏈反應法(RT-PCR)：檢測膽汁、血清和糞便中戊肝病毒核糖核酸(HEV-RNA)。本法靈敏度高，特異性強，但在操作過程中易發生實驗室污染而出現假陽性。
4、應用基因重組戊肝病毒多肽作為抗原建立蛋白吸印試驗（Western Blot，WB）：檢測血清抗- HEV。此法較ELISA法靈敏和特異，但操作方法較復雜，檢測所需時間較長。
戊型肝炎應根據流行病學資料、症狀、體征和實驗檢查綜合診斷。確診則以血清學和病原學檢查的結果為准。
