從目前看，無論是慢性乙肝還是慢性乙肝病毒攜帶者的治療都必須采取綜合療法。
一、慢性乙肝病毒攜帶者的抗病毒治療。原則上不用干擾素，特別是e抗原陰性者。可考慮用拉米夫定，但是一定要和其他抗病毒藥物和/或免疫調節藥物和/或其他藥物合用，以希望在發生耐藥株之前出現e系統轉換。另外也可試用其他抗病毒藥物，如苦參素(注射或口服)、單磷酸阿糖腺苷、膦甲酸鈉等，但都沒有很多經驗。
二、慢性乙肝病毒攜帶者的免疫調節治療。近年來研究很多，大都處於探索階段，但很值得試用和研究。
1、特異性免疫治療(1)乙肝疫苗加各種佐劑。國內外的材料均說明，乙肝疫苗本身就有一定的治療作用，其機理尚不清楚，療效不很好，因此目前多主張聯用某些免疫刺激劑，如有人試驗聯用左旋咪唑搽劑(塗布劑)及潘生丁等。也有人主張聯用各種佐劑，如各種細胞因子、卡介苗素、少量弗氏佐劑等。
(2)乙肝疫苗+乙肝免疫球蛋白。
每單位劑量中含60μgHBsAg和38μgHBIG，以氫氧化鋁為佐劑，每3周肌注1次，共3次。其作用機理尚不太清楚，值得試用。
(3)帶有T細胞表位的乙肝疫苗和DNA疫苗報告比較多，目前國內外正在研究中。
2、非特異性免疫治療一般認為非特異性免疫治療對慢性HBV感染可能沒有作用，但胸腺肽α1對慢性乙肝有一定治療作用，提示非特異性免疫對治療慢性HBV感染可能也起一定作用。
(1)左旋咪唑搽劑(塗布劑)。左旋咪唑是古老的細胞免疫增強劑，但口服不良反應較大，其塗布劑可減少不良反應，保留其增強免疫的作用，近年來應用較多，可能有一定療效。
(2)卡介苗及卡介苗素。卡介苗也是古老的免疫增強劑，但只能皮內注射，一旦注入皮下，可發生寒性膿瘍。為克服這一缺點，有人倡導用卡介苗素，但療效尚需進一步研究。
(3)胸腺肽α1(日達仙)及國產胸腺肽。日達仙對慢性乙肝有一定療效。有的國產胸腺肽含有1%左右的α1，故有人認為應用大劑量(160-200mg)，也可取得類似日達仙的療效。
(4)細胞介素類。如IL-2、IL-12等。
(5)其他。如真菌多糖類，值得進一步研究。有人認為口服潘生丁可能有誘生干擾素的作用，也需要進一步證實。
有人擔心，應用免疫調節治療會引起病情惡化，當然這是可能的，應用干擾素也會出現這種情況，因此應當密切觀察。一般認為，如只有血清轉氨酶的輕-中度升高，而病人一般情況良好，則可能是有效的一種表現，可在密切觀察下，繼續治療;但如出現黃疸和/或明顯的胃腸道症狀，則應馬上停藥，並積極處理。但是，最近也發現有的免疫因子，如IL-2、IFN-γ等也可通過非細胞溶解機理清除乙肝病毒，因此看來，免疫調節治療也不一定會引起病情惡化。
總之，從目前看，無論是慢性乙肝還是慢性乙肝病毒攜帶者的治療都必須采取綜合療法。
