肝髒是脂肪代謝的重要場所，對脂類物質的消化、吸收、分解、合成、運輸等過程起著十分重要的作用。當糖尿病引起糖、脂肪代謝紊亂時，這些作用均被破壞，使脂質過多地進入肝髒內，於是大量的脂肪酸被肝髒攝取，並以脂肪的形式在肝內堆積而形成脂肪肝。
此外，當肝細胞被損害時，引起甘油三酯與載脂蛋白的合成障礙；或肝內游高脂肪酸氧化減低、而致甘油三酯合成相應增加，均可形成脂肪肝。
隨著對激素的深入研究，發現48歲以上的更年期女性患者，由於卵巢功能衰退，雌激素分泌減少，可引起脂質代謝障礙，故認為脂肪肝的形成與雌激素分泌減少有關。
