急性丙型肝炎雖然有部分患者可以自愈，但患者若不及時治療，轉成慢性的幾率可高達50%以上。所以對所有急性丙型肝炎患者應該給予積極治療。包括適當休息、保肝、降酶及抗病毒等，其中抗病毒治療尤其重要。慢性丙型肝炎患者如果轉氨酶不正常，就要進行系統抗病毒治療。目前，雖然用於抗病毒的藥物較多，但首選干擾素。大多數肝病專家已達成共識：不使用干擾素等於放棄治療。從中可看出干擾素在治療丙型肝炎中的重要作用。治療劑量一般在3百-6百萬單位，隔日肌注1次，療程一般為6？2個月，有條件者可使用更長時間。療程過短，肯定影響療效，且易復發。近期，國外已有長效干擾素問世。長效干擾素的半衰期可長達40小時，相當於目前使用的普通干擾素的10倍。對病毒可產生持續的壓力，療效可明顯增高。另外，干擾素聯合病毒唑治療可明顯增加療效。
順便再強調一句，得了丙型肝炎千萬不要盲目相信以賺錢為目的的“醫商”的誘惑，不要相信“神醫”的“祖傳秘方”。因為丙型肝炎的發展速度遠快於乙型肝炎，一定要到正規醫院接受正規治療，而且，這種治療需要一個比較長的時間。
