甲肝病毒的潛伏期最短15天，最長45天，平均30天。感染了甲肝病毒後，有相當一部分人，可沒有任何症狀，甚至肝功能檢查也正常，而到恢復期卻可產生甲型肝炎病毒抗體。另一部分人經過2~6周的潛伏期後才出現臨床症狀，但不同的人臨床表現可有不同。根據甲肝臨床症狀輕重不同急性黃疸型與急性無黃疸型。（1）、急性黃疸型甲型肝炎的臨床過程甲肝可分黃疸前期、黃疸期、恢復期三個階段，一般總病程約2~4個月。
黃疸前期：病人大多急性起病，有畏寒發熱、全身乏力、肌肉酸痛、食欲不振、惡心嘔吐、腹痛腹瀉、及腹脹等症狀。亦有少數患者並無明顯黃疸前期症狀而直接進入黃疸期.可有肝區壓痛及觸痛，皮疹，尿膽紅素陽性，肝功能檢查ALT升高，抗HAV—IgM陽性等症狀。此期短者2~3天，長者2~3周，平均5~7天。
黃疸期：各種典型症狀和體征先後出現，年色逐漸加深，繼而鞏膜黃染，皮膚逐漸變黃，約於1~2周內達高峰，此時可有短期大便顏色變淺，皮膚瘙癢 ，心動過緩等現象。約在2！3周內恢復正常65%患者肝腫大至肋緣下1~3cm,可有輕度脾腫大。整個黃疸期持續2~6周，也有短者2天，長至95天或更長者。
恢復期：黃疸消退而臨床上症狀減輕以至消失。此期持續時間2周至4個月不等，平均1個月左右。90%以上的病人在起病後半年內完全恢復。
（2）急性無黃疸型甲型肝炎 ：為臨床最常見的類型，占急性肝炎病例的90%以上。其臨床症狀較輕，僅表現為乏力、食欲減退、腹脹和肝區疼痛等症狀，少數病人有發熱、惡心、腹瀉等症狀。體征以肝腫大為主，脾腫大為少見。相當多的病人僅有體征和肝功能改變，在普查時才被發現。一般3個月內恢復正常 。
有的人無症狀，轉氨酶只有短暫升高後即恢復正常，或根本不升高，而只有抗甲型肝炎病毒免疫球蛋白M（IgM）抗體1：4000以上陽性，到恢復期IgM抗體消失，代之以抗甲型肝炎病毒免疫球蛋白G（IgG）抗體陽性。
