甲肝病毒主要存在於甲型肝炎患者或隱匿性感染者的糞便中，排毒或長至2～3周，在潛伏期末和發病初期大量排毒。因此，甲型肝炎潛伏期後期及黃疸出現前數日傳染性最強。當黃疸高峰後逐漸消退時，病情好轉，傳染性亦減弱。一般黃疸出現後兩周，雖部分患者糞便中仍可極出病毒顆粒，但實際傳染性明顯下降；黃疸出現後3周時，患者糞便中已很難找到甲肝病毒，此時基本上無傳染性。近年有人認為，急性甲型、乙型肝炎患者同住一室，對其出院的乙型肝炎患者進行隨訪觀察，未發現交叉感染甲型肝炎的現象。因此，對黃疸消退後的甲型肝炎患者，已無需再行嚴格限制或隔離。但為了最大限度地防止甲型肝炎病毒擴散，我國規定對甲型肝炎患者采取隔離措施，自發病日起不少於30日。
