慢性乙型肝炎的根本治療措施是抗病毒。目前明確有效的抗乙肝病毒藥物有α-干擾素和以“拉米夫定”為代表的核苷類藥物，我國科學家研究成功的雙環醇和氧化苦參鹼也具有一定的抗病毒作用，但確切療效仍在觀察中。慢性乙肝患者抗病毒治療的適應證是血清丙氨酸氨基轉移酶(ALT)高於正常的2～10倍、HBeAg和HBV- DNA陽性。
干擾素是人體內本身就存在的一種生物活性物質，最早是由英國科學家於1957年發現的。最初，科學家們把滅活的流感病毒接種於雞胚細胞內，結果發現這些細胞可以分泌一種可溶性物質來抑制和干擾流感病毒的復制，所以將這種物質命名為“干擾素”。以後科學家們進一步發現，當人體發生任何病毒感染時，都能產生干擾素進行防御，從而進一步明確了干擾素的抗病毒作用。根據抗原成分和細胞來源的不同，可將干擾素分為 α、β和γ三種。目前臨床上廣泛應用的是α-干擾素，我們現在已經可以通過細胞生物學和基因工程進行工業化大批量生產。
干擾素治療的目標是有效控制病毒感染，最大程度降低病毒復制;改善肝組織學改變、緩解臨床症狀、穩定肝功能;從長遠來看，則是預防肝硬化和原發性肝細胞癌的發生。成人劑量為每次300萬～500萬單位，肌內注射或皮下注射，隔日1次或每周3次，療程不短於半年。干擾素抗乙肝病毒的平均療效為30%～40%，其與藥物劑量、療程成正比。
和其他抗病毒藥一樣，干擾素的使用也必須在專業醫師的指導下進行，切不可草率行事，應掌握好適應證和禁忌證。有糖尿病、甲狀腺功能亢進等自身免疫性疾病的患者，有癫痫、失代償性肝硬化的患者以及有精神病或精神病家族史的患者不適合干擾素治療。在開始用干擾素治療時，患者可能出現發熱、鼻塞流涕、四肢關節酸痛等類似流感的症狀，部分患者甚至可能出現血清轉氨酶一過性升高現象，這是藥物的正常反應，不必緊張。為了減少這一副作用，可以從小劑量開始，待身體適應後改為常規劑量。發熱、關節酸痛嚴重者可服用阿司匹林類解熱鎮痛藥對症處理。在整個治療期間應定期復查，目的是觀察療效和不良反應，特別是應注意有無白細胞和血小板減少。白細胞和血小板明顯減少者應減少用藥劑量，甚至停藥。
