干擾素分α-干擾素。β-干擾素和γ-干擾素三種，分別由人體白細胞、纖維母細胞及致敏淋巴細胞所產生，其中以α-干擾素作用最強。其作用機理是阻斷病毒繁殖和復制，但不能進人宿主細胞直接殺滅病毒。臨床試驗表明高劑量則高療效，但高劑量亦伴有更多的副作用。比較每日1次或隔日1次注射，病毒抑制程度無差別。因此臨床一般用3萬單位，隔日1次或每周3次，療程 3－6個月，可達到 30％-45％HBeAg陰轉率，其中 5％－25％HBsAg及HBVDNA可望陰轉。
鑒於單用干擾素治療效果不太令人滿意，自80年代開始試驗聯合療法，如干擾素與阿糖胞苷、無環島苷及與免疫調節劑聯合應用，初步試驗表明對慢性乙型肝炎病人有較好的反應。
大劑量應用干擾素後可出現高熱、寒戰、低血壓、惡心、腹瀉、肌痛及乏力等。初期可有流感樣症狀，暫時性脫發，白細胞和血小板減少，亦可發生貧血，停藥後可消失。但長期使用的副作用尚未見報道。
