乙肝病毒最常用的血清學標志是：表面抗原（ｈｂｓａｇ）、表面抗體（抗－ｈｂｓａｇ）、ｅ抗原（ｈｂｅａｇ）、ｅ抗體（抗－ｈｂｅａｇ）、核心抗體（抗－ｂｈｃ）。 即“兩對半”。
表面抗原：是乙肝病毒的外殼蛋白，本身不具有傳染性，但它的出現常伴隨乙肝病毒的存在，所以它是已感染乙肝病毒的標志。它可存在於患者的血液、唾液、乳汁、淚水、鼻咽分泌物、精液及陰道分泌物中。在感染乙肝病毒後２－６個月，當轉氨酶升高前２－８周時，可在血清中測到陽性結果。急性乙肝患者大部分可在病程早期轉陰；慢性乙肝患者該指標可持續陽性。
表面抗體：是對乙肝病毒免疫和保護性抗體。常在乙型肝炎恢復後期出現陽性。此時表面抗原已轉陰數月。血清中表面抗體滴度越高，保護力越強，持續時間也越長（３－５年以上）再次感染乙肝病毒後，表面抗體可在２周內滴度明顯升高。但也有表面抗體陽性而又發生乙型肝炎者，這種情況可能為不同亞型感染。９０％接受乙肝疫苗注射者的表面抗體可轉陽。極少數情況下表面抗原和抗體均為陽性，常見於不同亞型的乙肝病毒感染；免疫功能低下的患者，血液中的表面抗體常不能處理表面抗原。
核心抗體：通常在表面抗原出現後３－５周，肝炎症狀出現前即可在血清中檢出。高滴度的核心抗體陽性常標志乙肝病毒正在復制，有傳染性。可持續存在數年至數十年。低滴度的核心抗體表示乙肝病毒既往感染。
ｅ抗原：在乙肝病毒感染後表面抗原陽性同時或其後數天可測得ｅ抗原。乙肝表面抗原在血內高峰期亦是ｅ抗原的高峰期。在肝炎症狀出現後１０周內逐漸下降，在表面抗原轉陰前可轉陰。如果ｅ抗原持續陽性，則可發展為慢性持續性感染。ｅ抗原陽性說明乙肝病毒在體內復制活躍，表明傳染性強。在慢性乙肝患者中，ｅ抗原指標轉陰而ｅ抗體轉陽過程中臨床上可出現明顯的肝功惡化。極個別情況下可見表面抗原陰性而ｅ抗原為陽性。
ｅ抗體：在ｅ抗原轉陰後數月出現ｅ抗體陽性。ｅ抗體陽性預示患者的傳染性已顯著或相對降低。病毒復制程度已降低或明顯緩解。
