1、不該用藥時，卻用了藥。患者中的80％左右，都是病毒攜帶者，尤其是兒童和少年，處於免疫耐受階段，此時對於各種治療無應答，各種治療用藥都起不到理想的效果，此時大量用藥治療，不僅浪費錢財，還會打破機體免疫沉默狀態，使得肝功出現異常，有時這種異常反反復復，纏綿難愈。
2、該用藥時，用錯了藥。乙肝患者肝功異常，轉氨酶升高，本應是抗病毒治療的時機，應該使用合適的抗病毒藥物，而肝硬化腹水，應該加強利尿，補充白蛋白，如選用干擾素等抗病毒藥物，可致使肝功能進一步惡化。
3、用藥時斷時續，不連貫。想起來就吃藥，想不起來就斷藥；工作一忙，就忘吃藥了；一出差，又忘吃藥了，這些問題時有發生，這種時斷時續的吃藥，不能保證藥物在血液中恆定和有效的濃度，達不到控制疾病發展的目的。
4、用藥療程不足。乙肝的抗病毒治療需要時間較長，一個療程至少需要半年至一年時間，其中干擾素療程至少為半年，如果療程太短，根本起不到抑制病毒的作用。抗肝纖維化的療程同樣需要漫長時間，短期使用，起不起軟化肝髒，降解肝髒纖維組織的目的。
5、誤信廣告。一些乙肝患者為了治療疾病，盲目相信一些廣告。部分患者看到一則抗乙肝藥物在轉基因鼠上試驗的報道，就認為這種藥物一定能治好乙型肝炎。還有一些肝功能正常的乙肝“小三陽”患者，盲目聽信廣告，花了很多錢，不但沒有使乙肝病毒清除，還因藥物中毒導致了藥物性腎損害。
任何一種有效的抗病毒藥物都要按照國際上統一的GCP標准，經過臨床前（動物）、Ⅰ期（健康人和少數病人）、Ⅱ期和Ⅲ期（國際多中心、雙盲對照）的臨床研究才能正式上市，有些藥物還要經過Ⅳ期臨床研究。在這些試驗中，不僅要觀察藥物的有效性，還要觀察其安全性。這一過程，至少要經過2～3年。在這些試驗結束前，誰也不能斷定其在臨床上肯定有效和安全。因此，不能盲目地相信廣告，要到正規醫院進行全面的檢查和治療。
6、漠視抗病毒治療。現實中，有許多乙肝病毒攜帶者可能終生不發病，這使得一些應該接受治療的慢性乙型肝炎患者懷著僥幸的心理，並且誤認為抗病毒治療無關緊要，只要等到肝功能異常時服用一些降酶藥物就行了。這類患者長期不願就醫，也不願配合醫生的系統治療，甚至放棄定期的肝功能和病毒學指標的監測。雖然很多乙肝病毒攜帶者終生不發病，但是如果不接受應有的治療，一旦病情嚴重而不得不就醫時，往往已經發展為重型肝炎或肝硬化期。
7、停藥越早越好。許多患者有決心和乙肝病毒打一場“持久戰”。但對於這場戰斗究竟要堅持多久，缺乏科學認識。知名醫生說，“抗病毒治療要有耐心，能夠停藥當然好，但前提是必須完成足夠的療程，達到預定的治療目標。”e抗原陽性病人實現“雙達標”後要堅持治療至少1年，並定期復查。至於e抗原陰性的病人，按照我國的指南和國際上大多數指南的建議，基本療程應堅持兩年半。
8、繁停換藥。一些患者在用藥過程中自行停藥，不能持續用藥，多次換藥，結果往往達不到治療效果。專家告誡說，一般藥物都有具體的藥量及療程，如果藥量不足或療程不夠，就會反彈，病情就可能反復。一旦出現反彈、病情反復，重新再開始治療，該病菌已經產生耐藥性，不但效果不好，還要多花錢。
