抗病毒治療是目前公認的對抗乙肝的“法寶”。而從臨床來看，患者本人常常成了自己征服乙肝的最大“絆腳石”，有些患者本應治療但卻未及時治療，或是誤信廣告、游醫的說辭，接受了錯誤、無用的治療，導致喪失最佳治療時機，甚至使病情惡化。
慢性乙型肝炎治療主要包括抗病毒、免疫調節、抗炎保肝、抗纖維化和對症治療，其中抗病毒治療是關鍵。有些患者轉氨酶升高了，醫生就會開一些降轉氨酶的藥，有黃疸了給一些治黃疸的藥，但最關鍵的仍是抗病毒治療。抗病毒治療可以最大限度地長期抑制或消除HBV，減輕肝細胞炎症壞死及肝纖維化，延緩疾病進展，有效減少和防止肝髒失代償、肝硬化、肝癌的發生。
有人認為，治療乙肝選了一種藥一直用下去就可以了。這種觀念是錯誤的。
一種藥物對不同的人療效是不同的，而且藥物在使用過程中有可能產生耐藥性。耐藥是乙肝長期抗病毒治療的嚴重的臨床問題。HBV對核苷(酸)類似物耐藥後可能導致臨床後果，諸如病毒學反彈、生化學反彈，發生血清學復發，加重肝病進展，此外，病毒耐藥還可影響後續抗病毒治療的療效。
當耐藥發生後，應考慮使用強效的抗病毒藥物或聯合治療，也就是通過換用或加用另一種抗病毒藥物來解決。從臨床上來看，加藥的療效更好，但是會增加治療成本，如果經濟上不允許，換用其他抗病毒藥物也是可取的。在核苷類似物初治患者中，通過使用強效抗病毒藥，使用高耐藥基因屏障、耐藥性不交叉的抗病毒藥物，以及提高病人的依從性等，可以將HBV耐藥時間延遲，降低耐藥率。
用藥不能相信偏方遠離對肝髒有副作用藥
有些肝炎患者因求治心切，往往相信虛假宣傳，服用各種自制中藥制劑；有的長期服用“偏方”、“驗方”，有的用藥不符合適應症，硬性亂用；有的重復大量使用所謂保肝藥;有的誤認為中藥沒有毒副作用，不加選擇隨便使用。肝髒在這些零亂、復雜的藥物形成化學反應的影響下，中毒情況越來越重，肝髒損害日見加重。
專家提醒，乙肝患者不應盲目聽信一些所謂的偏方、秘方和不實廣告宣傳，自行停藥和換藥，因為這樣會耽誤了治療時機，嚴重者還可能加重病情。在抗病毒治療的基礎上可適當選用抗炎和保肝藥物，但不宜同時應用多種抗炎保肝藥物，以免加重肝髒負擔及因藥物間相互作用而引起不良效應。
藥物對肝髒的損害方式不同，有的藥物對肝髒有直接毒副作用，破壞肝細胞的整個結構；有的藥物作為抗原，在體內和肝髒內通過抗原、抗體反應而破壞肝細胞。所以，乙肝患者應忌服下列對肝髒有損害的藥物：抗生素類及其他化療藥物(例如四環素、紅霉素等)、抗腫瘤藥(例如絲力霉素、更生霉素等)、抗寄生蟲藥(氯喹、硝酸氰胺等)、中樞抑制藥及抗痛風藥(氯仿、三氯乙烯等)、抗抑郁藥(異丙肼、阿米替林等)、激素類及其有關藥物(甲基睾丸酮等)。
