PBC的典型症狀是疲勞和瘙癢。皮膚抓痕、黃疸以及肝脾增大雖不是特征性的體征但較多見。黃疸通常出現在疾病過程的晚期，但也可見於20%～40%早期階段的患者。90%～95%的患者是女性，發病年齡通常在30～65歲。其他的症狀是右上腹痛、厭食等。瘙癢可出現在疾病過程中的任何時期，並且隨著疾病的進展偶爾可能緩解。相反，黃疸通常是持續性的，同時也是判斷預後最重要的指標。
PBC其他的臨床表現包括皮膚色素沉著、黃瘤、黃斑瘤。晚期患者可出現腹水、食管胃底靜脈曲張破裂出血、肝性腦病等肝硬化並發症的表現。由於腸腔內膽鹽缺乏導致脂肪瀉常見，脂肪瀉也可能因為胰腺胰酶不足或PBC患者有時伴發的乳糜瀉有關。由於病情嚴重導致骨質疏松，患者可能發生自發性骨折。
隨著醫學知識的普及，由肝炎病毒所導致的肝功能異常已為大家所熟知，並已有了一定的防范意識，如：乙肝疫苗全民接種、血液制品管理和抗病毒藥物的使用。然而，非病毒性肝炎導致的反復肝功能異常卻令許多患者和臨床醫生困惑。反復鹼性磷酸酶升高且伴有明顯瘙癢、黃疸的患者，在排除病毒性肝炎以及藥物性、酒精性、脂肪性肝病等常見病因後，應考慮PBC的可能。盡早明確病因，采取相應治療將有助於病情的控制，提高生活質量。
