因為大多數肝囊腫在臨床上並無明顯症狀，導致患者不能及時地發現疾病，通常是直到體檢時才能被確診，因而不利於病情的康復。因此，患者要將肝囊腫的治療重視起來。在肝囊腫的眾多治療方法中，中藥療法以其效果好、無毒副作用的優勢而被患者接受並廣泛應用。
1、在中醫理論中有肝腎同源之說，那麼針對腎囊腫的發病特點，中藥治療方式也可以用到肝囊腫治療中來。因為肝囊腫或腎囊腫的治療上不能只求活血通絡帶動囊內液體的傳送，還要抑制囊壁上皮細胞繼續分泌液體。這樣才能起到好的治療效果。
2、因為肝囊腫或腎囊腫的治療上，不能只求活血通絡帶動囊內液體的傳送，還要抑制囊壁上皮細胞繼續分泌液體。這樣才能起到好的治療效果。專家解釋說中藥具有了很高的活性物質，再經過滲透後的選擇性靶向定位作用，直接針對肝髒病變組織。
3、中藥療法以其效果好、無毒副作用而備受患者的青睐，對於部分肝囊腫患者來說，可以服用清熱祛肝火的中藥輔助治療，但是一定要在中醫醫師的指導下服用，切勿自行用藥。
4、並與病變組織緊密融合，釋放出有效中藥成份，對病變組織具有極強的修復性與清除性，發揮強大的活血通絡作用，擴張肝血管，作用於囊腫部位，並使原有囊液逐漸被重吸收和排出體外，使囊腫縮小。進而使肝髒組織壓迫性減小，組織功能也會慢慢修復。
5、應用活血通絡的中藥湯劑來進行治療，因為肝囊腫一般都是膽管發育異常引起的，也就是平時人們說的流動不暢，選擇歸肝經的中藥能起到一定的效果。在中醫理論中有肝腎同源之說，那麼針對腎囊腫有作用的中藥治療方式也可以用到肝囊腫的治療中來。
對於大多數患者來說，其所患肝囊腫均為小的肝囊腫，其最大直徑均不超過3厘米。肝囊腫與肝血管瘤一樣，不是腫瘤，不長大、不惡變，對患者無威脅，不要緊。所謂“不要緊”是意味著“不急”和不需要處理。事實是肝囊腫甚少自發破裂。但肝囊腫患者仍需定期隨訪，每年做1-2次B超是需要的。
