血吸蟲性肝硬化見於血吸蟲病的晚期，由於蟲卵在肝內大量沉積，特別沉積在門靜脈干支系周圍的小分支內，引起門脈干支系統，尤其是第2、3、4級分支周圍纖維化，即所謂干線型肝硬化。切面示各級干支周圍有大小不一的白色纖維團塊，纖維化嚴重者可引起干支閉塞，這些團塊的收縮可使肝髒變形，肝表面顯示本病特征性的塊圖狀溝紋，外觀凹凸不平，分界不甚清晰。由於肝腺泡的主要血供來自門靜脈小支，血供營養不良可致肝細胞萎縮、脂肪變性和非特異性變性，肝小葉有塌陷和纖維隔形成。也有人認為，雖然進入肝窦的門脈血流被陰，導致門脈高壓，但肝動脈仍可進入肝窦，維持葉的血液供應和營養，因而肝小葉完整，肝細胞受損很輕，而肝硬化的確切定義完整，肝細胞受損很輕，而肝硬化的確切定義是肝細胞變性壞死，殘存肝細胞形成再生結節，網狀蛋白支架塌陷，結締組織增生形成纖維隔，最終導致原有肝小葉結構破壞，形成假小葉。因而從這個角度講，有人認為血吸蟲病僅引起肝纖維化。
