肝穿刺進行肝組織活檢，通常是使用一種特制的細穿刺針，利用負壓吸引或切割的方法，取出少許肝組織，在顯微鏡下直接觀察肝細胞形態及病理改變。肝組織活檢是一種能直接了解肝組織病理變化，做出較精確診斷的檢查方法，也是肝髒疾病診斷和鑒別診斷的重要依據，是慢性肝炎診斷的“金標准”，因而肝組織活檢在乙型肝炎診斷中極其重要。
肝組織活檢可以幫助醫生對慢性肝炎患者做出更准確的診斷，或給治療提供依據。例如：自身免疫性肝炎、肝豆狀核變性、肝糖原儲積症等，肝組織活檢可以為這些肝病的診斷提供重要線索；又如：慢性乙肝病毒感染者肝髒的炎症和纖維化程度與治療及預後有密切的關系，只有臨床症狀和化驗結果，沒有肝組織活檢很難做出正確的判斷。一些表面上看來肝功能正常的乙肝病毒攜帶者，經肝組織活檢發現10%的人肝組織基本正常，70%的人肝組織有輕微病變，20%的人有慢性活動性肝炎或肝硬化。
重症肝炎的嚴重性與肝細胞壞死的程度有直接關系。病理顯示肝細胞破壞嚴重者預後較差；肝小葉結構紊亂，纖維組織增生多，預示病人將發展到肝硬變。在治療過程中，借助於肝組織活檢可以客觀、准確地判斷藥物的治療效果。
國內外大量文獻表明，在拉米夫定和阿德福韋等抗病毒藥物治療1年後，絕大部分患者肝組織炎症程度和纖維化程度有了明顯改善。所以，在診斷和治療需要時，醫生常要求患者進行肝穿刺檢查。
