乙肝病毒造成胃黏膜損害的原因可能與下列因素有關：
乙肝病毒存在於胃黏膜上皮細胞內，由於乙肝抗原———抗體免疫復合物在細胞中沉積而引起炎症反應，從而削弱和破壞了胃黏膜的屏障保護作用。
患乙肝後，胃酸形成的功能紊亂，導致胃酸過多，過多的胃酸會損害胃黏膜，胃酸過多與胃潰瘍的發生相關。
免疫功能紊亂，產生自體免疫反應，導致胃黏膜損害。
肝功能受損後，肝髒對激素的滅活功能減退，白蛋白的含量降低，這就減弱了對胃黏膜的修復能力。
藥物刺激所引起。乙肝患者，特別是慢性乙肝患者需較長時間服藥。病人求愈心切，往往服藥種類過多，或幾種藥同時服下，忽視了藥物間的相互作用會對胃黏膜產生刺激。有些藥物本身就對胃黏膜有刺激作用，特別是有些苦寒性中草藥對胃有一定的刺激作用。
有些慢性乙肝患者有不同程度的肝硬化、門脈高壓，使胃部血流緩慢，胃黏膜下瘀血，胃黏膜因缺血缺氧及營養障礙而致損害。
