感染乙肝病毒並非都需要治療根據疾病發展分為三個階段，其中免疫清除期是抗病毒治療最關鍵時期。
慢性乙肝病毒攜帶者：又稱為免疫耐受期。指乙肝病毒表面抗原持續存在6個月以上，無肝病相關症狀和體征，轉氨酶基本正常。這一人群肝功能正常，乙肝病毒載量很高，HbeAg陽性。此階段不是抗病毒治療的時機，但具有傳染性，因此，有一些工種，如幼職、軍人、餐飲業、野外作業，為限制性工種。但可以正常工作、生活，包括結婚生育等。免疫耐受期患者應每年隨訪1-2次。
慢性乙型肝炎患者：又稱為免疫清除期。處於這個時期的患者肝功能異常，ALT高於正常值的2倍，乙肝病毒載量很高，大於105拷貝/ml，這是抗病毒治療的關鍵時期。經過正規有效的抗病毒治療，相當多的患者病情得到控制，乙肝病毒載量明顯下降，甚至達到檢測不到的水平，實現了e抗原血清轉換（e抗原轉陰或產生了e抗體），ALT恢復正常。
非活動性HbsAg攜帶者：又稱表面抗原攜帶期。這類人群肝功能和乙肝病毒載量正常，HbsAg陽性，HbeAg陰性或者e抗體（HbeAb）陽性。處於此期的患者基本沒有傳染性，但還存在病情反復的可能，故應該定期隨訪。
