在臨床抗病毒治療的藥物中，核苷類藥物做為一線藥物而被醫生和患者接受。但核苷類藥物有一個很重要的問題就是耐藥的問題，如果在治療中發生了耐藥問題我們該怎麼辦？
抗病毒治療的核苷類藥物耐藥也類似於抗生素的耐藥，乙肝患者體內每毫升血液中的病毒數可能是十的五次方個，這個量是很大的，在這麼大量的病毒裡面耐藥的病毒是一部分，不是所有的病毒都會變異，就是看誰占主導地位。
如果耐藥病毒都占到主導地位，臨床上的表現是hbv dna又上升了，隨之轉氨酶會出現波動，也就是說肝髒又有炎症了，這樣的情況一旦出現，就是說我們治療過程當中的收益就會明顯減低，這個也是有病理報告證實的。一旦出現耐藥，會導致炎症的復發、纖維化進展的加速，所以實際上病情的持續獲益會有部分喪失。
但是同時也要注意一點，是不是說以前延緩的過程都喪失了？不是，前面有效的這一部分也還是贏得了時間，即便出現了耐藥，也不要過於悲觀，這個也是應該注意的。
耐藥的出現一定要注意什麼呢？早期檢測，所以我們現在核苷類藥物都要求這個病人每三個月進行一次檢測，檢測的目的就是及早發現耐藥，及早的進行處理，不要導致不好的後果再來進行處理。
