在脂肪肝的治療過程中，應減少藥物對肝髒產生毒性。各種藥品進人人體後，均由肝髒代謝和解毒，因而過多地服藥一是增加肝髒負擔，二是有些藥物具有肝毒性，會損傷肝細胞。因此，要慎重地選藥，少服或盡量不服不必要的藥物。脂肪肝的錯誤認識要糾正
強調去除病因和綜合治療的重要性。由於至今尚無防治脂肪肝的特效藥物，事實上將來也不一定會發現這類靈丹妙藥。因此，脂肪肝患者不應對藥物治療產生幻想，如果只把希望寄托在藥物上，而不重視其它治療方法，肯定不會取得滿意的療效，並且可能會誘發藥源性疾病。對於大多數脂肪肝來說預防勝於治療，故應對肥胖、酒精中毒等脂肪肝高危人群進行衛生宣教及干預，以減少脂肪肝相關疾病的發生，防止脂肪肝的流行。
由於脂肪肝患者常合並其他全身性疾病，而這些疾病有時比脂肪肝的防治更為重要，故在考慮脂肪肝的診療方案時，應有整體的觀點，根據患者脂肪肝的分型和分期及其伴隨疾病狀態和嚴重程度，制定具體的治療方案。在藥物治療過程中需警惕減肥、降脂以及治療高血壓和糖尿病藥物的肝腎毒性，故這些藥物均需在醫生指導及相關指標監測下使用。
我國各地有關中藥驗方、中成藥以及中西醫結合方法防治脂肪肝的實驗及臨床研究眾多，其中可能不乏治療效果良好者，但確切療效及其安全性有待進一步的臨床試驗考證。國內外還沒有一種療效確切，可使各種脂肪肝完全逆轉的中藥方劑。一些在廣告上介紹的所謂治療脂肪肝的特效中藥是不可靠的，這些藥方均未經過嚴格的臨床試驗驗證。此外，長期大劑量服用中藥，特別是中藥復方，也會導致肝腎功能損害等藥源性疾病，切忌對患者進行“中藥無毒”的誤導。
脂肪肝為一慢性疾病，並且復發性極高，因此，脂肪肝患者需要長期接受以飲食、運動、行為修正等為主的綜合性治療，但是藥物治療多為短期行為，療程一般為6個月至2年，必要時根據臨床症狀及實驗檢查結果“按需進行”，以鞏固療效，防止疾病復發及盡可能減少藥源性疾病的發生。
有肝炎病史的患者，往往自認為肝病加重而更加限制活動、增加營養，這樣反而會使體重增加，脂肪肝加重，肝區疼痛加劇，形成惡性循環。個別患者因小膽管受壓可有輕度黃疸，還有一部分患者只表現為長期輕、中度轉氨酶升高，而無任何不適感，只是在體檢時發現轉氨酶升高、血脂尤其是三酰甘油升高。
治療脂肪肝的藥物很多，主要分為降脂性藥物、護肝去脂藥和中醫中藥。但需說明的是，目前脂肪肝的治療仍以祛除病因、積極治療原發病和堅持合理飲食習慣為主，藥物僅起輔助治療作用，應根據脂肪肝的病因和病情合理選用。
脂肪肝治療要點
1.戒酒：適用於單純性脂肪肝和以酒精性脂肪肝為主的中毒性肝病，戒酒後，一般在2～4周肝功能指標可恢復正常。
2.節食：食用低脂肪、高蛋白、低糖、低熱量和富含纖維的食品，並補充足夠的維生素B1、B2、B6以及葉酸、鋅、膽鹼、蛋氨酸。
3.運動鍛煉：增加運動量，控制體重。
處方藥應在醫生指導下使用，不良反應詳見藥品說明書，在此不再復述。
脂肪肝輔助治療藥物的作用評價目前，治療脂肪肝的藥物雖多達100余種，但僅僅有微弱的輔助治療作用，需長期服用。要獲得較好的臨床效果，必須消除病因，包括戒酒、減少高脂肪攝人、盡量少吃藥等。同時，應補充維生素（維生素B、復合維生素B片、維生素E—C合劑、維丙胺）及礦物質和微量元素（如鐵、鋅、鈣）。
