2013年11月，《2013全國名醫院排行榜》最新版公布，最新榜單以2012年全國名醫院排行榜為基礎，綜合近一年各醫院綜合實力，重新排名，與2012年《全國名醫院排行榜》榜單相比，不少醫院依然榜上有名，也不乏新晉榜單醫院。
榜單顯示，全國最好醫院綜合排名中，武漢同濟醫院由去年的第10位上升到第9位，廣東省人民醫院下降1位；最好的神經內科醫院，北京協和醫院被擠出前5名；全國最好的神經外科醫院中，北京天壇醫院依舊穩居榜首；最好的心血管專科醫院中，上海遠大心胸醫院入榜排名第5位；16個榜單中，北京協和醫院占據其中10個榜單，綜合實力最強。
《2013年全國名醫院排行榜》仍為16個榜單，依次為：
1.全國最好醫院綜合排名；
2.全國最好的神經內科醫院；
3.全國最好的神經外科醫院；
4.全國最好的腫瘤科醫院；
5.全國最好的心血管病專科醫院；
6.全國最好的耳鼻喉科醫院；
7.全國最好的眼科醫院；
8.全國最好的骨科醫院；
9.全國最好的婦產科醫院；
10.全國最好的燒傷科醫院；
11.全國最好的口腔科醫院；
12.全國最好的消化內科醫院；
13.全國最好的呼吸內科醫院；
14.全國最好的內分泌科醫院；
15.全國最好的兒科醫院；
16. 全國最好的肝病醫院。
附：各榜單上榜醫院及排名
一、全國最好醫院綜合排名
No.1 北京協和醫院
No.2 廣州中山一院
No.3 上海華山醫院
No.4 解放軍總院（301醫院）
No.5 上海瑞金醫院
No.6 北京天壇醫院
No.7 西安西京醫院
No.8 上海仁濟醫院
No.9 武漢同濟醫院
No.10 廣東省人民醫院
二、全國最好的神經內科醫院
No.1 北京宣武醫院
No.2 吉林大學第一臨床醫院
No.3 北京中醫藥大學附屬東直門醫院
No.4 北京天壇醫院
No.5 河北醫科大學第二醫院
No.6 北京協和醫院
No.7 北京軍區總院
No.8 上海市中醫醫院
No.9 復旦大學醫學院兒科醫院
No.10 浙江省中醫院
No.11北京世紀友好醫院
三、全國最好的神經外科醫院
No.1 北京天壇醫院
No.2 上海華山醫院
No.3 哈爾濱醫科大學第一臨床醫院
No.4 西安唐都醫院
No.5 上海長征醫院
No.6 廣州珠江醫院
No.7 上海仁濟醫院
No.8 北京大學航天中心醫院
No.9 重慶新橋醫院
No.10 浙江大學附屬第二醫院
四、全國最好的腫瘤科醫院
No.1 中山大學腫瘤醫院
No.2 中國醫學科學院腫瘤醫院
No.3 天津市腫瘤醫院
No.4 復旦大學附屬腫瘤醫院
No.5 第二軍醫大學東方肝膽外科醫院
No.6 北京腫瘤醫院
No.7 湖南省腫瘤醫院
No.8 第一軍醫大學附屬南方醫院
No.9 廣東省人民醫院
No.10 北京市廣安門醫院
五、全國最好的心血管病專科醫院
No.1 北京阜外醫院
No.2 北京安貞醫院
No.3 北京協和醫院
No.4 武漢協和醫院心血管疾病研究所
No.5 上海遠大心胸醫院
No.6 山東大學齊魯醫院
No.7 哈爾濱醫科大學第一臨床醫學院
No.8 西安西京醫院
No.9 廣東省心血管病醫院霍英東心髒中心
No.10 武漢亞洲心髒病醫院
六、全國最好的耳鼻喉科醫院
No.1 北京同仁醫院
No.2 北京協和醫院
No.3 解放軍總院（301醫院）
No.4 復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院
No.5 上海仁濟醫院（西部）
No.6 山東大學齊魯醫院
No.7 海軍總醫院
No.8 中山大學腫瘤醫院
No.9 鄭州大學第一附屬醫院
No.10 湖北省人民醫院
七、全國最好的眼科醫院
No.1 北京同仁醫院
No.2 北京協和醫院
No.3 中山醫科大學中山眼科中心
No.4 復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院
No.5 天津眼科醫院
No.6 溫州醫學院附屬眼視光醫院
No.7 山西省眼科醫院
No.8 解放軍總院（301醫院）
No.9 西京醫院
No.10 北京大學人民醫院
No.11北京民眾眼科醫院
八、全國最好的骨科醫院
No.1 北京積水潭醫院
No.2 解放軍總院（301醫院）
No.3 上海長征醫院
No.4 北京大學第三醫院
No.5 廣州軍區廣州總院
No.6 上海瑞金醫院
No.7 北京大學人民醫院
No.8 山西醫科大學第二醫院
No.9 廣州中醫藥大學第一附屬醫院
No.10 寧波市第二醫院
九、全國最好的婦產科醫院
No.1 北京協和醫院
No.2 復旦大學附屬婦產科醫院
No.3 北京婦產醫院
No.4 武漢同濟醫院
No.5 四川大學華西第二醫院（華西婦產兒童醫院）
No.6 上海仁濟醫院
No.7 廣州中山一院
No.8 廣州中醫藥大學附屬第一醫院
No.9 黑龍江中醫藥大學附屬第一醫院
No.10 青海紅十字醫院
十、全國最好的燒傷科醫院
No.1 北京積水潭醫院
No.2 重慶西南醫院
No.3 北京解放軍304醫院
No.4 上海瑞金醫院
No.5 上海長海醫院
No.6 甘肅省人民醫院
No.7 西安西京醫院
No.8 天津市第四醫院
No.9 廣州中山一院
No.10 長沙湘雅醫院
十一、全國最好的口腔科醫院
No.1 四川大學華西口腔醫院
No.2 北京大學口腔醫院
No.3 上海市第九人民醫院
No.4 第四軍醫大學附屬秦都口腔醫院
No.5 武漢大學附屬口腔醫院
No.6 北京協和醫院
No.7 天津市口腔醫院
No.8 廣東省口腔醫院
No.9 中山大學附屬光華口腔醫院
No.10 浙江大學醫學院附屬二院
十二、全國最好的消化內科醫院
No.1 廣州南方醫院
No.2 上海仁濟醫院
No.3 北京協和醫院
No.4 北京軍區總院
No.5 西安西京醫院
No.6 復旦大學附屬中山醫院
No.7 浙江省中醫院
No.8 浙江大學醫學院附屬第一醫院
No.9 重慶醫科大學第二醫院
No.10 北京地壇醫院
十三、全國最好的呼吸內科醫院
No.1 武漢同濟醫院
No.2 廣州醫學院第一附屬醫院
No.3 北京協和醫院
No.4 重慶新橋醫院
No.5 北京紅十字朝陽醫院
No.6 中國醫科大學附屬一院
No.7 江西中醫學院附屬醫院
No.8 四川大學華西醫院
No.9 北京東直門醫院
No.10 山西醫科大學第一附屬醫院
十四、全國最好的內分泌科醫院
No.1協和醫院
No.2上海仁濟醫院
No.3長沙湘雅二院
No.4天津醫科大學代謝病醫院
No.5上海市瑞金醫院
No.6中山大學附屬第一醫院
No.7福建醫科大學附屬協和醫院
No.8安徽醫科大學第一附屬醫院
No.9北京中醫藥大學東方醫院
No.10廣西醫科大學附屬第一醫院
十五、全國最好的兒科醫院
No.1上海市新華醫院
No.2北京兒童醫院
No.3北京大學第一醫院
No.4重慶醫科大學附屬兒童醫院
No.5復旦大學附屬兒童醫院
No.6南京中醫藥大學第二附屬醫院（江蘇省第二中醫院）
No.7西安市西京醫院
No.8湖北十堰市太和醫院
No.9濟南市兒童醫院
No.10天津市腫瘤醫院兒童腫瘤科
十六、全國最好的肝病醫院
No.1 解放軍第三0二醫院
No.2 北京大學人民醫院肝病研究所及肝髒外科
No.3 解放軍總醫院消化科肝膽外科
No.4 第二軍醫大學肝膽外科醫院及長海醫院
No.5 復旦大學附屬中山醫院肝癌研究所
No.6 首都醫科大學附屬北京佑安醫院
No.7 北京軍區總醫院肝病研究所
No.8 北京地壇醫院
No.9 上海傳染病院
No.10第三軍醫大學西南醫院傳染病附院
