雖然丙型肝炎臨床症狀相對較輕，但易向慢性化轉變，轉氨酶常呈波浪起伏升高，持續達６個月者（占５７％）比乙肝（占２８％）更為多見。長潛伏期和輕型或無黃疸者，易發展為慢性，女性較男性易發展為慢性。經皮傳播者，特別是輸血後丙型肝炎較非腸道外傳播者更易發展為慢性。據報告，輸血後丙型肝炎慢性化頻率高達４０％－６０％，而且，大多數形態學改變為慢性活動性肝炎，其中１０％－２０％發生肝硬化，有時在急性起病後幾個月至１年內，在無症狀的情況下，不知不覺地演變為肝硬化，而且，少數患者病情迅速發展，最後死亡。
丙型肝炎的一種最常見的類型，是在生化和組織學初次康復２－３年後，又出現轉氨酶緩慢升高或間歇升高，容易忽略而不被發現，最後多數演變為慢性肝炎和肝硬化。
丙型肝炎的高危人群是指經常腸道外暴露血淬得，如血友病患者、靜脈內濫用藥物成瘾者、血液透析患者、骨髓和腎移植患者、心外科患者以及經常經皮注射的患者。據來自西班牙的報告，血友病患者、靜脈內濫用藥物成瘾者及血液透析患者，丙型肝炎病毒抗體陽性率分別為６４％、７０％及２０％，較一般人群明顯為高。
