肝癌的確診必須要實驗室全面的檢查才能診斷。需要做哪方面的檢查呢？
1、甲胎蛋白(AFP) 是診斷肝癌的主要指標和特異性最強的標記物。
AFP是胎兒時期肝髒合成的一種胚胎蛋白，由胎兒肝細胞、卵黃囊細胞內粗面內質網核糖顆粒所合成。胚胎早期(約14周)即合成，20周達高峰，其後急劇下降，出生後1～2周消失或僅存微量<20µg/L，常規方法測不出。在成人，如果血清中出現高濃度的AFP，提示肝細胞性肝癌或生殖腺胚胎瘤，在兒童則提示肝母細胞瘤或肝細胞肝癌。少數胃、胰、膽管、結直腸癌AFP也可升高，但其絕對值不如肝癌高。慢性肝炎、肝硬化可有AFP的分子變異體。因此，血清AFP檢測結果必須結合臨床與B超、CT等檢查才有診斷意義。
2、r-谷氨酰轉移酶(r-GT)，在r-GT胎兒期很高，出生後急劇降低，故又叫癌胚酶。
無論在癌前階段還是肝癌形成階段，肝細胞中r-GT值顯著增高。因此;測定血中r-GT可作為早期診斷肝癌的依據之一。然而膽道梗阻、膽道癌及轉移性肝癌患者血中r-GT亦可增高，故r-GT對肝癌缺乏特異性。近年來，用聚丙烯酰胺凝膠梯度電泳法，可將r-GT分為11～13條區帶，其中，肝癌特異的是Ⅱ、Ⅱ'和Ⅰ'帶。其中，r-GT2在原發性和轉移性肝癌的陽性率可提到90%，特異性達97.1%。非癌肝病和肝外疾病假陽性率低於5%。r-GT2與AFP無關，在低濃度AFP肝癌及假陰性肝癌中，也有較高的陽性率。小肝癌r-GT2陽性率為78.6%。
3、異常凝血酶原(AP)，肝髒合成凝血酶原無活性前體，經維生素K r羧化為活性形式。
肝癌時，肝癌細胞的微粒體內維生素K依賴性羧化體功能障礙，羧化酶活力下降，導致谷氨酸羧化不全，從而形成異常凝血酶原。肝癌細胞自身具有合成和釋放異常凝血酶原的功能。用放射免疫法測定AP，以≥250µg/L為陽性，則肝癌患者的陽性率為67%，而良性肝病，轉移性肝癌時僅少數呈陽性，故對亞臨床肝癌有早期診斷價值。
4、血清巖藻糖苷酶(AFu) AFu屬溶酶體酸性水解酶類，主要生理功能是參與含巖藻糖的糖蛋白、糖脂等生物活性大分子的分解代謝。
AFu超過110nKat/L應考慮原發性肝癌，診斷原發性肝癌敏感性為75%，特異性為90%，對AFP陰性肝癌和小肝癌陽性在70%以上。繼發性肝癌、良性肝占位病變均陰性，但肝硬化、慢性肝炎的假陽性較高。
5、α1-抗胰蛋白酶(AAT) 肝癌細胞具有合成分泌AAT的功能，當腫瘤合並細胞壞死和炎症時升高。
6、鹼性磷酸酶同工酶I(ALP-I) ALP-I是一種癌胚蛋白，由肝癌細胞產生，幾乎僅見於肝細胞肝癌，特異性強，但陽性率低。
7、血清鐵蛋白和酸性同工鐵蛋白(HIF) 肝髒含豐富的鐵蛋白，也是清除循環中鐵蛋白的主要場所。
肝病時鐵蛋白從受損的肝細胞中逸出，肝髒本身處理鐵蛋白的能力減退，致血清中鐵蛋白濃度升高。同工鐵蛋白在肝癌時由於肝癌細胞合成增多，釋放速度加快，故對肝癌診斷有一定意義。有些學者認為血清鐵蛋白對肝癌具有中度敏感性與特異性。其特異性雖低於AFP，但對AFP陰性者具有診斷意義。若肝硬化患者AFP與鐵蛋白均為陰性，則合並肝癌的可能性極小。鐵蛋白升高，往往可以發現低AFP含量。HBsAg陰性，有嗜酒史患者的小肝癌。肝硬化等疾病血清鐵蛋白雖可升高，但常同時伴有血清鐵及轉氨酶的升高，可資鑒別。因此同時測定AFP與血清鐵蛋白，在高發人群肝硬化中檢出肝癌是一種十分有價值的方法。
8、醛縮酶同工酶A(ALD-A) 醛縮酶同工酶有A、B、C 3種形式。
A型主要存在於肌肉和胎肝組織，正常肝組織以B型為主。當肝細胞癌變時，ALD-A重新出現，並逐漸代替ALD-B。肝細胞肝癌ALD-A陽性率為76%，並且肝細胞肝癌分化越差，AID-A陽性反應越強。手術切除腫瘤或栓塞治療後，ALD-A濃度下降。AFP陰性肝癌陽性率>70%。
9、M2型丙酮酸激酶(M2-PyK)。
丙酮酸激酶(PyK)是糖酵解中的關鍵酶，有L、R、M1、M2型4種同工酶，胎肝及肝癌組織中主要是M2型。可視為一種癌胚蛋白，ELISA夾心法可測到Pg級微量靈敏度高的癌標志。在小肝癌階段即已明顯增高，分化愈差M2-PyK值增高愈明顯。消化道腫瘤亦可升高，而肝炎、良性肝腫瘤不高。
10、電子計算機斷層掃描(CT) CT具有圖像清晰、分辨力高，為無創檢查等優點。
注射造影劑後，可增強組織對比度，更提高了肝癌的檢出率。在各種影像檢查中，CT最能反映肝髒病理形態表現，如病灶大小、形態、部位、數目、有無病灶內出血、壞死以及門脈有無癌栓，病灶的浸潤性等。CT是首選的非侵入性診斷方法。
11、X線肝血管造影
是目前最敏感的診斷肝細胞肝癌的影像診斷方法，檢查准確率達88%～93%，對2cm以下的小肝癌往往能做出更准確迅速的診斷。
方法：經股動脈將造影導管插至肝動脈，然後注入造影劑。如導管插至肝右或肝左動脈，則稱為超選擇性肝動脈造影。肝癌的選擇性肝動脈造影表現有：①腫瘤血管排列紊亂、迂曲、增粗;②腫瘤區出現因大量造影劑自毛細血管外滲所致團塊狀影;③腫瘤外周有血管包繞，此管壁僵硬、不規則、粗細不均;④血管變形、移位;⑤造影劑池：腫瘤壞死或肝窦擴張，形成異常的腔隙，當肝血管內造影劑排空後，這些腔隙中仍有造影劑殘留;⑥動靜脈瘘;⑦肝動脈擴張。血管造影對肝細胞性肝癌檢測能力取決於病灶新生血管多少，多血管型肝癌即使2cm以下或更小亦易顯示。如為少血管性則無法與膽管細胞性肝癌區分。肝動脈造影是一種創傷性檢查，有發生出血、栓塞等並發症的危險，要做到高選擇性造影需要一定的經驗，不列入常規檢查項目，僅在B超或CT等非創傷性檢查不能確診時方考慮應用。肝血管造影檢查意義不僅在診斷、鑒別診斷，在術前或治療前可用於估計病變范圍，特別是了解肝內播散的子結節情況;血管解剖變異和重要血管的解剖關系以及門靜脈浸潤可提供正確客觀的信息。對判斷手術切除可能性和徹底性以及決定合理的治療方案有重要價值。此外血管造影還可起治療作用，有些不宜手術的患者可在造影時立即進行化療栓塞或導入抗癌藥物或其他生物免疫制劑等。
12、肝穿刺活檢
肝穿刺有一定的局限性和危險性。由於超聲能准確顯示肝細胞肝癌結節的部位，深度及大小，故近年來國內外廣泛開展在超聲引導下活檢或細針穿刺行組織或細胞學檢查，以獲得肝癌的組織學診斷依據。
