非寄生蟲性囊腫（non parasitic cysts of liver）據屍體解剖和剖腹手術資料，其發病數為1．4‰～5．3‰，以潴留性囊腫和先天性多囊肝為多見，此兩者常難以區分。潴留性肝囊腫為肝內某個膽小管由於炎症、水腫，瘢痕或結石阻塞引起分泌增多或膽汁潴留而致，多為單個。先天性多囊肝常為多個，多無膽汁潴留。常伴有腎或其他髒器的多囊症，約50％伴有多囊腎。
囊腫大小自數mm至10cm或更大，增大速度緩慢。患者通常在40～50歲後出現臨床症狀。肝右葉囊腫多見。囊腫可布滿肝髒，也可僅局限於膽小管而表現為膽小管的分段扭曲及擴張。囊內液體成分隨囊腫類型、大小及有無並發症而改變。多囊肝的囊液澄清，不含膽汁；若囊內出血則囊液呈棕或紅色；如並發感染，囊液可呈膿性。由於肝代償再生力強，故肝功能衰竭很少見。
臨床表現與囊腫大小有關，主要為消化道症狀如消化不良、食欲減退、嗳氣、惡性、嘔吐和右上腹痛。有時腹痛難忍，平臥後可減輕，繼發感染後出現寒戰和發熱。巨大囊腫壓迫膽總管或肝管可致黃疸，但少見。
腹部觸診可扪到腫大肝髒或富有彈性的腫塊，表面不平整。肝功能多半正常。合並其他髒器囊腫者有相應症狀，如多囊腎有腎功能不全和高血壓。超聲波檢查肝區可見多個液性暗區。如有多囊腎，腎區也可見液性暗區。CT示明顯低密度區，造影劑增強無填充。肝放射性核素掃描可顯示邊界清楚的占位性病變，血池掃描無填充，乃可與實質性腫瘤及血管瘤相鑒別。
肝囊腫的治療近年來采用超聲導引下行囊腫穿刺抽液，囊內注入適量無水酒精，方法簡便、安全。對巨大有壓迫症狀或囊腫伴繼發感染者，有時仍須外科手術處理。
