應根據臨床特點、肝功能檢查，參考流行病學資料。排除HAV、HBV、HCV感染和其他原因引起的急性肝損害。
診斷戊型肝炎的方法很多，目前國內常用的方法有以下幾種：
①特異性抗體檢測：抗HEV，即戊型肝炎抗體，包括抗HEV-IgM和IgG。在急性期血清中可測出高滴度的抗HEV-IgM，恢復期抗HEV-IgM滴度下降或消失。但取而代之的是血清中產生抗HEV-IgG。國內大多數醫院目前均使用酶聯免疫法檢測特異性抗體，其測定抗HEV-IgM最有臨床意義。
②免疫熒光法：檢測肝組織中戊型肝炎病毒抗原。此方法須進行肝穿活檢。
③免疫電子顯微鏡：用患者恢復期血清作抗體，檢測急性期患者的糞便及膽汁中病毒抗原，或用已知病毒檢測患者血清中相應的抗體。
④逆轉錄聚合酶鏈反應法(RT-PCR)：檢測膽汁、血清和糞便中戊型肝炎病毒核糖核酸(HEV-RNA)。
