α-干擾素治療慢性乙型肝炎的最終目標是有效抑制乙型肝炎病毒的復制，改善肝功能和肝組織炎症損害，阻止肝硬變及預防肝癌變。經國內外大量臨床研究充分顯示了α-干擾素治療慢性乙型肝炎的療效。
療效評價標准：目前，α-干擾素治療慢性乙型肝炎的效果評價是以肝功能改善狀況和血清乙型肝炎病毒復制標志是否陰轉為依據，通常評價分為3種類型：1）完全應答，即療程結束時或隨訪中血清hbeag轉陰和hbvdna轉陰（斑點雜交法），血清alt恢復正常。2）部分應答，於治療後hbvdna陰轉，而hbeag不變，alt未恢復正常。3）無應答，即hbvdna滴度無明顯下降，hbeag和alt無改善。
近期和遠期療效：據國外多中心、嚴格對照研究結果，以α-干擾素300-1000萬單位，每周3次，4-6個月治療慢性乙型肝炎患者，其完全應答率為25-50%。國內資料也相仿為30-40%，大多數資料顯示於療程結束時完全應答率為40%左右，而停藥後約10%出現復發。
令人感興趣的是近年來陸續有文獻報道α-干擾素治療慢性乙型肝炎的後續效應。國外有資料顯示97例慢性乙型肝炎病人，接受α-干擾素治療後完全應答率為34%，在停藥後隨訪1-9年中，又增加了43%的完全應答。另有報道62例經干擾素治療的慢性乙型肝炎患者中，56%乙型肝炎病毒長期被抑制，並見14%患者的hbsag陰轉。國內也有類似報道，接受α1b干擾素治療者，療程結束時，完全應答率為52%（18/33），隨訪3年時，為70%（15/21），6年時過75%（12/16）。由此說明，α-干擾素治療慢性乙型肝炎，遠期效果較治療結束時可提高10-20%。因此，對治療結束後隨訪中出現的遲緩效應，應引起重視。
療效影響因素：α-干擾素治療慢性乙型肝炎，其療效受諸多因素影響，也頗為復雜。如患者的遺傳背景、免疫狀態，肝組織炎症損害程度、乙肝病毒在體內存在的數量與狀態、干擾素品種和劑量、療程等都可能對療效有不同程度影響。現舉例如下：
1）民族背景：國外報告α-干擾素治療後若干年，可有一定比例hbsag消失，而中國患者則難見轉陰。
2）干擾素劑量：療效與干擾素劑量已成共識，大劑量效果優於中等劑量，所以現多推薦大劑量治療方案，摒棄小劑量。深圳東湖醫院研究表明α-1b干擾素治療慢性乙型肝炎，結果表明應用500萬單位者優於300萬單位，前者完全應答率55.3%，後者為32.6%。
3）乙肝病毒量：血清hbeag、hbvdna強陽性者應用干擾素，療效差亦早有共識。上海中山醫院觀察了治療前肝內乙肝病毒標志表達與干擾素療效關系，結果顯示hbsag、hbcag均陰性或只有其中一個表達陽性者較二者均陽性者療效為優。
4）病毒基因變異：α-干擾素治療前或治療期間，出現乙肝病毒前c基因變異者，療效可能受到影響或出現復發可能。
此外，有人顧慮長期應用干擾素會有干擾素抗體出現，所幸的是療效與干擾素抗體之間並無必然聯系，況且有的干擾素，如α-1b干擾素治療過程中，抗體出現的機會不多。
