問題之一：“保肝”藥物並不能起到真正的保肝作用。對策：強調針對病因的治療，采取釜底抽薪的章法。目前保肝藥物眾多，如益肝靈(水飛薊素)、甘利欣、垂盆草、門冬氨酸鉀鎂、肝炎靈等，這些藥物在一定程度上可以降低血清轉氨酶，使肝髒炎症得到不同程度的緩解。然而在臨床上，血清轉氨酶水平高低並不能評價肝內炎症活動的輕重。有時應用降酶藥物使血清轉氦酶恢復正常，但肝組織炎症壞死仍很明顯，病情仍然在發展。因此，還要加強隨訪，注重病因治療，也就是抗病毒治療。但目前由於抗病毒治療療程長，花費貴，適應症較窄，許多患者只能選擇廉價的保肝治療，只要肝功能正常就罷了。其實由於引起肝炎的根本原因並沒有消失，病毒復制始終存在。即便是肝功表面上正常了，但是肝組織內部炎症並未熄滅。如果給病人做一個肝穿組織檢查，會發現肝髒組織炎症活動依然存在，免疫組化檢查也會發現肝組織內部病毒復制活躍。
問題之二：抗病毒治療雖然是關健，但是還拿不出過硬的藥物。對策：正規使用好目前幾種有效藥物，避免濫用和亂用。乙肝病毒的持續感染是造成乙肝慢性化的主要原因，並可導致病情發展，惡化至肝硬化、乙肝病毒相關性肝細胞癌。因此，抗病毒治療是慢性乙肝治療的關鍵。但目前尚無一種能迅速、徹底清除乙肝病毒的藥物。國內外醫學界公認有確切療效的抗乙肝病毒藥物主要有兩大類：α干擾素和核苷類似物(拉米夫定、阿德福韋等)。這些藥物是通過抑制病毒復制來治療的，所以要長期甚至多次治療，才能把病毒控制在極低水平，阻止乙肝向肝硬化和肝癌發展。目前抗病毒治療存在的主要問題和難點是：1.療程漫長，終點難以達到。2.療效有效，容易反復。3.治療費用昂貴，百姓難以承擔。4.亂和濫用情況很多。因此，要強調規范乙肝的抗病毒治療。這幾種藥物都已制定出專家共識，指出了正確的用藥方法，各級醫務人員應該認真學習和貫徹。
問題之三：聯合治療，費用攀升，療效難定。對策：聯合治療不等於“八寶粥”，需有章法。由於單獨使用一種藥物難以治愈乙肝，現在提倡聯合治療。例如干擾素聯合胸腺素，干擾素聯合拉米夫定，拉米夫定聯合阿德福韋，抗病毒藥物聯合免疫調節劑，抗病毒藥物聯合抗肝纖維化藥物、保肝藥物，等。病人往往使用十幾種藥物(甚至更多)聯合治療，費用昂貴，但療效並沒有明顯提高。從理論上講，聯合治療各有道理，但怎樣聯合治療目前尚缺規范，往往成為過度診療的原因。從歐美國家最新的乙肝防治指南看，許多聯合治療並不可取。例如干擾素和拉米夫定聯合應用，並沒有提高療效的證據;干擾素聯合胸腺素治療，也不提倡。我國治療乙肝聯合用藥非常普遍，聯合方式五花八門，中西藥物混合一團，更缺乏嚴格的科學觀察和依據。這不僅加大了患者的經濟負擔，也為規范治療乙肝帶來隱患。聯合用藥必須有個章法，需要及時洞察國際治療乙肝的動態，結合國內實際情況，定期或不定期發布乙肝治療指南，明確規定哪些治療可以實施，哪些治療已經淘汰，如何聯合用藥等等。
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