脂肪肝的治療主要從去除病因、調整飲食、中醫藥治療三方面入手。某些祛脂藥物如膽鹼、蛋氨酸、維丙胺等有一定作用，但目前對此療效尚不十分肯定，且副作用較多，故一般慎用。
①祛除病因：尋找並消除病因是治療脂肪肝的根本方法。如酒精性脂肪肝主要在於戒酒；糖尿病性脂肪肝在於積極地治療糖尿病；肥胖性脂肪肝在於有效控制體重；營養失調性脂肪肝在於調整營養物質的供給。同時要避免各種對肝髒有毒性的藥物。大多數輕度脂肪肝在除去致病因素後即可獲得好轉。
②調整飲食：這是脂肪肝治療的重要一環。特別是營養失調性脂肪肝，不可營養過度，也應避免營養缺乏。一般脂肪肝飲食需高蛋白、適量脂肪和糖類；肥胖性脂肪肝應從節制飲食入手，同時加強適當的運動鍛煉，冰淇淋、糖果之類少食，可多食豆類食物；營養不良性脂肪肝應予高蛋白膳食及足夠的糖類及脂肪，但由於消化腺分泌不足，只能逐步增加攝入量。
此外，還有中醫中藥食療等，如枸杞子、葛根、馬蘭等有保肝去脂作用，可多食用。蔬菜中有去脹作用的有大蒜、芹菜、紫菜、香菇、海帶等，在日常生活中可增加這類食物的食入量。
