當前，人們越來越認識到，乙肝病毒的復制及程度，是病情進展最為重要的獨立危險因素。也就是說，凡是直接反映乙肝病毒復制的HBVDNA濃度越高，發展為肝硬化、肝癌的比例越高。所以，國內外的乙肝防治指南都明確指出，在慢性乙肝綜合治療中，抗病毒治療是關鍵。我國的乙肝防治指南（以下簡稱指南）強調，只要有適應症，且條件允許，就應進行規范的抗病毒治療。
選好病人把握治療起點並不是所有慢性乙肝病人都需要抗病毒治療，也不是所有慢性乙肝患者都適合抗病毒治療，這一點非常重要。但目前發現，有的醫務人員任意擴大治療對象，將肝功能一直正常又未做肝組織學檢查的慢性乙肝病毒攜帶者盲目進行抗病毒治療，結果往往難以奏效；更有對乙肝病毒復制標記物陰性或低濃度的非活動性乙肝表面抗原攜帶者也進行抗病毒治療，讓他們白白浪費大量錢財，又增加痛苦和心理負擔。
這種情況，在我們專家門診和會診中屢見不鮮。醫生應按照指南規定，慎重選定治療對象。目前國內外一致公認和我國指南明確規定的抗病毒治療適應症，主要有2條：
一是HBVDNA>105拷貝/ml（HBeAg陰性者為>104拷貝/ml）。
二是丙氨酸轉移酶（ALT）>正常值2倍以上或肝組織學檢查有明顯炎症壞死。
選好藥物實施規范化個體化治療醫生應充分了解目前國內外抗乙肝有效藥物進展的正確信息，這些信息最可靠的來源是來自國內外權威學術組織頒發的乙肝防治指南或相關的指導性文件，它們大多有循證醫學證據，集中了眾多主流專家的集體智慧，是指導臨床醫生不斷更新知識的最好教材。這些信息大多可以在一些正規的公益性網站中查到。
目前被國內外權威學術部門和主流專家公認並一致推薦、又經過國家藥監局正式批准的抗乙肝病毒治療的藥物只有兩類六種，即干擾素類藥的普通干擾素和長效干擾素（聚乙二醇干擾素），核苷類似物藥的拉米夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋和替比夫定。這兩類六種藥都是一線治療藥，只要我們全面了解它們的優缺點，針對病人的病情（病毒載量、轉氨酶水平）、條件（經濟、醫保）和個人意願，在充分與患者溝通的情況下合理應用其中任何一種藥物，都應屬於正確的選擇。
把好拐點適時調整治療策略現在醫學界提出了一個“乙肝治療線路圖”的觀念，主要是把病人抗病毒治療半年（24周）時的病毒DNA水平作為決策點，來預測治療一年和兩年時的效果。如果治療半年時病毒載量越低，則一年和兩年時療效就越好，出現耐藥的可能性較小；如果治療半年時病毒載量不能降到低水平，則表示現有的治療方案並不理想，可以考慮調整治療策略。
因此，不論開始治療選擇何種方案，一旦實施後都要注意做到及時監察，特別是HBVD-NA的下降速度和幅度，下降速度越快，幅度越大，抑制病毒效果就越好，耐藥變異機會會更少。經治醫生和病人都要重視這個決定預後的決策點，通常稱為拐點，從而使我們對治療更加心中有數。警惕耐藥早發現早處理接受核苷類似物長期治療的病人都有發生病毒耐藥變異的可能，並隨用藥時間的延長而增加比例。
但不同藥物產生耐藥變異概率和時間有較大差異，例如應用拉米夫定治療的患者中發生耐藥變異率較高，時間也可能較早。特別是治療過程中HBVDNA下降遲緩的患者往往會較早較多發生耐藥變異，更應密切觀察。可通過HBVDNA定期復檢而早期發現病毒反彈，即病毒載量下降後重新回升，這是發生耐藥變異的苗頭。此時有條件的就應進行病毒耐藥變異的相關檢測，並及時調整治療方案，采取控制病毒耐藥的相應處理。
對拉米夫定耐藥，可首選加用阿德福韋進行長期聯合治療或聯合治療顯效後單用阿德福韋繼續治療；也可改用恩替卡韋治療，但需要加大劑量至1mg（2片）/日。由於患者已存在有拉米夫定耐藥毒株，故發生恩替卡韋耐藥的可能明顯增加。根據我們的臨床實踐體會，長期治療中耐藥變異難免出現，但已不像過去那麼可怕，只要密切監察，並正確及時處理，多能達到預期療效。
堅持治療用足療程把握終點臨床研究和實踐表明，慢性乙肝的抗病毒治療，如同治療高血壓、糖尿病一樣，需要長期治療，才能最大限度持久抑制乙肝病毒復制，從而達到控制疾病進展、預防發生肝硬化和肝癌的目標。所以要讓每一位接受抗病毒治療的病人，作好長期治療的准備。治療千萬不可任意中斷。對治療終點，國內外已有共識，基本要求是達到HBVDNA消失、肝功能復常後再鞏固治療1年以上，最好同時達到HBsAg陰轉，療效會更持久。
