乙肝大三陽的後果及危害具體表現在：“大三陽”治愈難度大，乙肝病毒是一種嗜肝病毒，與肝細胞核內DNA的結合力很強，也就是說，乙肝病毒控制了肝細胞的復制密碼，誕生肝細胞的同時，乙肝病毒也隨之被復制出來，有一些藥物能夠清除血清用細胞漿中的乙肝病毒，但要清除與肝細胞核內DNA結合在一起乙肝病毒，是十分困難的。
大三陽的後果十分嚴重，如不注意調養與治療，部份患者會發展成為肝炎後肝硬化甚至肝癌，臨床資料顯示，80%的肝癌患者可查出其乙肝指標為“大三陽”；極少數病例病程發展迅猛，肝細胞出現大面積壞死，成為重型肝炎，危及生命。
乙肝大三陽時期病毒復制最活躍，且有高度傳染性。如不及時治療，隨病毒量的不斷增大，對肝髒的損害也會逐漸加重，導致肝功能嚴重異常，有可能會引起肝硬化和肝癌。
