外科手術是治療原發性肝癌的一種方法。如果肝髒只有一部份有癌腫，其余部份情況良好，並未硬化，醫生會考慮動手術，切除癌腫的部份，稱為肝髒切除如果切除其中一葉肝髒，則稱為葉切除。肝髒具有驚人的自我修復能力。即使被切去四分之三，也能夠迅速地重新生長。由於肝癌發病比較隱匿，發現多屬晚期，已失去了手術的最佳時間，多采用中西醫結合治療。
1.肝癌的手術治療方法
肝癌的治療仍以手術切除為首選，早期切除是提高生存率的關鍵，腫瘤越小，五年生存率越高。手術適應證為：
①診斷明確，估計病變局限於一葉或半肝者;
②無明顯黃疸、腹水或遠處轉移者;
肝功能代償尚好，凝血酶時間不低於50%者;
④心、肝、腎功能耐受者。
在肝功能正常者肝切除量不超過70%;中度肝硬化者不超過50%，或僅能作左半肝切除;嚴重肝硬化者不能作肝葉切除。手術和病理證實約80%以上肝癌合並肝硬化，公認以局部切除代替規則性肝葉切除無期效果相同，而術後肝功能紊亂減輕，手術死亡率亦降低。由於根治切除仍有相當高的復發率，故術後宜定期復查AFP及超聲顯象以監察復發。
由於根治切除術後隨訪密切，故常檢測到“亞臨床期”復發的小肝癌，乃以再手術為首選，第二次手術後五年生存率仍可達38.7%。肝移植術雖不失為治療肝癌的一種方法，國外報道較多，但在治療肝癌中的地位長期未得到證實，術後長期免疫抑制劑的應用，病人常死於復發。對發展中國家而言，由於供體來源及費用問題近年仍難以推廣。
2.姑息性外科治療
適於較大腫瘤或散在分布或靠近大血管區，或合並肝硬化限制而無法切除者，方法有肝動脈結扎和(或)肝動脈插管化療、冷凍、激光治療、微波治療，術中肝動脈栓塞治療或無水酒精瘤內注射等，有時可使腫瘤縮小，血清AFP下降，為二步切除提供機會。
