目前使用干擾素治療的主要對象是慢性乙型和丙型肝炎的病人。 在乙型肝炎病人中，有以下情況應用干擾素治療反應較好，
1.治療前血清ALT或AST有反復波動或酶的活力持續升高者；
2.治療前血清HBeAg的P/N值偏低（P/N 5～8）或HBV DNA水平低（《100Pg/ml）者；
3.病程較短者；
4.應用干擾素劑量宜大（300～600萬單位），隔日皮下或肌肉注射1次，即3～6MU/隔日，療程宜長，一般6～12個月為一療程；
5.肝髒病理有活動性炎症病變（如有碎屑樣壞死）者療效佳；
6.無重疊感染者（如丙型、丁型肝炎等）；
7.無HIV感染或免疫抑制劑治療者；
8.肝組織內含鐵量低者；
9.治療期間血清中無干擾素中和抗體產生者；
10.女性患者療效比男性為佳。
急性丙型型肝炎病人因有一半以上的人會發展為慢性丙型肝炎，一般認為應該用干擾素治療。
