肝穿刺檢查把肝纖維化分為6分：0分無纖維化；1-2分輕度、3分中度、4分有少數小結節形成，算做硬化前肝炎，不規范的診斷叫“早期肝硬化”；5分輕中度、6分重度肝硬化。這是肝組織的形態分類，因為肝髒是新陳代謝的器官，臨床分類按功能狀態分為輕度代償、中度代償和失代償肝硬化。組織學分類與功能分類相關，但並不完全一致，例如肝穿刺纖維化6分，只要有足夠數量的肝細胞，按肝功能可以是輕度代償性肝硬化。
替諾福韋有大組肝硬化病例臨床試驗，經5年治療，肝穿刺降低2分的患者占1/3，5分的輕中度肝硬化減輕為3分的中度纖維化；肝穿刺降低3分的患者占2/3，6分的重度肝硬化也可減輕為3分的中度纖維化。
用恩替卡韋治療肝硬化也可使肝纖維化逐漸降解，從而使肝硬化逆轉，但還沒有大組病例的臨床試驗，所以不及替諾福韋的結果明確，一般需要超過7、8年。
肝穿刺肝硬化逆轉不是停藥標志，就像慢性肝炎患者，服恩替卡韋2、3年後已經沒有肝髒病變，但須繼續維持治療。因為核苷類藥並不提高對病毒的免疫，肝內有病毒就可能反彈。過去的《乙肝指南》推薦過的停藥療程，一次次延長、一次次失敗，所以當前並沒有公認的停藥療程。至少須肝內病毒降低到極限、超敏的表面抗原反映肝內病毒水平，可能要以表面抗原作為標志，產生表面抗體後停藥應該比較可靠，用一線核苷類藥後這是能夠成功的，但當前還只有少數，經驗還有待積累。
有些肝硬化患者可能要終生服藥，但只要能長壽，終生服藥又何妨。許多人認為“服藥三分毒”，此話可能不全面。治療藥物無數種，藥性(包括毒性)各不相同，明顯毒性不會入藥，有輕微毒性用很小劑量能充分排洩的可以無害。其實，許多內科病用藥是終生的，如高血壓藥、阿司匹林、甲狀腺素替代藥物等。
