(一)肝癌的診斷
在排除妊娠和生殖腺胚胎瘤的基礎上，AFP檢查診斷肝細胞癌的標准為：①AFP大於55ug/L持續4周；②AFP由低濃度逐漸升高不降；③AFP在200ug/L以上的中等水平持續8周。
(二)鑒別診斷
活動性慢性肝炎和肝硬化病例有20%-45%的AFP呈低濃度陽性，多不超過200ug/L，常見於血清丙氨酸轉氨酶(ALT)明顯升高，AFP呈同步關系；一般在 l-2個月內隨病情好轉，ALT下降而下降。如AFP呈低濃度持續達兩個月或更久，ALF正常，應特別警惕亞臨床肝癌的存在，AFP異質體的檢測可提高診斷率及對肝癌和良性肝病有重要的鑒別價值。AFP陰性的肝癌可通過檢測其他腫瘤標志物並結合臨床及B超、CT等檢查進一步確診。
(三)療效評價及預後監測
AFP是原發性肝細胞肝癌的最靈敏、最特異的腫瘤標志、除AFP陰性肝癌的可能外，若AFP小於20ug/L者，原發性肝癌基本不可能；在100-300ug/L之間者必須進行隨訪，密切觀察AFP的動態變化，注意可能的小肝癌AFP在350-500ug/L，或含量明顯增高者，必須參考其他檢查，應高度警惕原發性肝癌的可能；如 AFP為500-1000ug/L，且含量在短期內不斷升高，原發性肝癌可能性很大，但必須建議做活檢；AFP大於 1000ug/L者，甚至在近期內 AFP含量迅速升高，則原發性肝癌診斷基本可確定。
AFP陽性患者進行AFP動態或定期檢查，有助於了解病情的發展。在手術切除化療、微波、乙醇注射等治療有效時，腫瘤縮小，AFP下降；如果腫瘤縮小而AFP上升，說明腫瘤發生轉移或播散。高水平AFP岔氣能夠表示預後不良或治療反應差。對於腫瘤切除患者，術後AFP降至20ug/L以下者，是預後明顯優於未降至正常者。
