一、抗病毒治療的最佳時機
感染乙肝病毒以後會有肝炎、肝硬化、肝癌三部曲，但並不是所有的人都會發生肝炎，也不是所有人都會發生肝硬化、肝癌。對於肝炎來講，最好的治療時機就是合適的時候。這個合適的時候是，HBV-DNA是陽性的和轉氨酶是增高的。
在轉氨酶升高的時候，我們會確定患者轉氨酶的升高是不是由乙肝病毒感染引起的。如果轉氨酶升高確實是乙肝病毒引起的，然後再確定是否由比較長時間的肝髒炎症引起；如果確定如此，我們要考慮這時的肝髒炎症是否可以自發的清除病毒；如果不可以自發清除病毒，我們就會給予治療。當確定轉氨酶升高是由乙肝病毒引起的，人體自身的免疫功能會對乙肝病毒發起攻擊，而這其中一部分免疫功能比較強的人可以利用這個時機將乙肝病毒清除掉。因此，並不是轉氨酶一升高，就馬上開始用藥。一般，我們會建議病人觀察半年，如果半年之內不能將病毒清除掉，這時候就需要用藥了。
但如果有的朋友在復查監測過程中發現，每年都有轉氨酶的反復波動，並且每年轉氨酶波動都是由病毒引起的，而這次波動的時候就不用再等半年了，就需要立即開始治療了。
另外一種情況需要考慮轉氨酶升高的水平，從目前的治療經驗來看，在轉氨酶升高超過兩倍上限的時候，治療效果比較好。當然也不是轉氨酶不到兩倍就不治療，要根據具體情況具體分析。只要確定肝髒存在炎症就應當治療，但治療效果可能會受一些影響。
但除此之外，也有一些特殊情況，轉氨酶不增高的時候也要考慮用藥，這裡也存在兩種情況。一是肝硬化，只要存在肝硬化，無論轉氨酶高低，都是越早治越好；二是因為某些疾病需要應用免疫抑制劑的時候（這種情況極其特殊），即使不存在肝髒炎症，也沒有肝硬化，需要提早應用抗病毒藥物。因為免疫抑制治療有可能打破自身免疫功能和病毒之間的平衡，把自身免疫功能給抑制住了，所以，提早應用抑制病毒的藥物，以免病毒活動，減少治療過程中出現潛在的肝髒損傷。
二、抗病毒治療的常用藥物
目前治療乙肝最主要的方法是抗病毒治療。慢性乙型肝炎、肝硬化都是乙肝病毒造成的，只有把原因去掉，我們才能控制肝髒炎症和肝硬化。除了抗病毒治療外，也可以有其他的治療，稱之為保肝、降酶、抗纖維化等，但實際上最主要的是抗病毒治療。
現在抗病毒藥物有很多，但實際上大概分兩大類：一類打針，一類口服。打針的藥物就是干擾素，口服的藥物就是核苷類似物，核苷類似物是一大類，也有很多種藥。兩類抗病毒藥物的作用機制不同。干擾素主要有兩個作用：一是抗病毒，直接抵抗、破壞乙肝病毒；二是，具有免疫調節作用，將人體自身的免疫功能調節得更好，以致停藥之後，人體的免疫功能得到恢復，仍可以控制病毒。而核苷類似物就是抑制病毒，打個比方，病毒是個彈簧，核苷類似物就是把彈簧壓住，起到抑制病毒的作用。
干擾素的好處是療程固定，如它的療程就是48周；另一個好處是，如果患者對干擾素治療有效，那麼，往往長時間有效，甚至終身有效。其缺點是，只有30%-40%的患者對干擾素有效，仍有60%-70%的患者對干擾素注射無效；其次，干擾素的副作用比較大，會出現發熱、感冒樣症狀、全身酸痛、掉頭發等。
核苷類似物的優點包括抑制病毒很快，吃藥後，可能2-4周，或12周，血液裡的乙肝病毒就檢測不到了，效果非常快；不打針、口服方便；副作用小，幾乎沒有副作用。缺點包括療程不太固定，患者一定要達到一個目標才能考慮停藥，達不到這個目標不能停藥；療效不太固定，停藥後容易復發，難以達到持久的穩定。
換句話說，打干擾素需要48周，就像上大學一樣，四年就畢業了，不管成績優秀不優秀，屬於學年制；而用核苷類似物屬於學分制，一定要把學分修滿才能畢業，具體多長時間能修滿學分，就因人而異了。所以，這兩類藥，一個療程固定，一個療程不可預測，具體如何選擇要根據病人的具體情況而定。
三、抗病毒治療最佳方式
如果一個患者年紀比較輕，並且還沒有生育，這時候往往會建議他首選干擾素。因為，這樣的朋友一旦注射干擾素有效，就可以終身有效，停藥過一段時間後，對生孩子也沒有影響。另外，年輕人用干擾素的效果的確比40歲以上的人要好，這也是干擾素的優點。然而，年齡偏大的人也並不是不適合應用干擾素。如果年齡大一點的患者，之前從來沒有治療過，條件允許的話，也可以先用干擾素治療。如果干擾素治療沒有效果的話，再換用核苷類似物。由於干擾素的副作用較大，年齡大的人可能耐受性會相對弱。
另外，如果先用了核苷類似物，因為不知道什麼時候能夠達到治療效果而停藥，也不知道需要觀察多長時間。而在這個時候，有的患者朋友就會問，是否可以停下來使用干擾素。這時答案就會比較含糊。因為，應用核苷類似物後，病毒已經被抑制了，再轉回用干擾素，就不一定有效了。所以，先用干擾素的話，如果干擾素有效了，我們就可以放心了；而如果干擾素無效，我們就改成核苷類似物，這時就可以放心應用核苷類似物了，反正干擾素已經用過無效了，這樣在實際過程中會比較方便、輕松。
女性應用干擾素的效果會比男性更好一些。有些核苷類似物對懷孕、妊娠相對安全，但有些藥物的安全性卻未知。所以，今後有生育要求的女性，可以優先選擇干擾素，如果干擾素有效了，之後停藥後，就可以放心生育了。
肝硬化的朋友是個例外，最好別用干擾素治療。當慢乙肝發展至肝硬化的時候，肝髒正常細胞會比較少。如果干擾素將自身的免疫功能調節起來時，免疫系統會攻擊含有病毒的乙肝細胞，一旦攻擊太厲害，肝髒的損傷就會很嚴重。所以，如果患者已經進展到肝硬化期，就不太適合應用干擾素治療了。
