濫用乙肝新藥的危害嚴重，主要體現在：
（1）醫療資源嚴重的浪費。據調查顯示，濫用乙肝新藥比例可達20%~30%。眾多的藥物給了本不該使用這些藥物的患者使用，加上濫用以後帶來的負面作用，如化驗檢查、影像學檢查的投入，各種醫生診療活動，使得大量醫療資源浪費。
（2）患者經濟負擔日益加重。乙肝病毒攜帶者原本是不應該進行抗病毒治療的，但是不少患者都在使用拉米夫定或干擾素治療，以拉米夫定為例，一個攜帶者使用拉米夫定年均花費應該是6000元左右，整個療程長達數年，也就是說每個攜帶者可能支出都要超過萬元，如果我國一億多乙肝病毒攜帶者都來嘗試一下這種治療，那將意味著萬億元的支出，這將是一個驚天動地天文數字，後果不堪設想，其實這些支出很可能沒有什麼收獲，因為乙肝患者機體尚處於免疫麻痺狀態，對於這些治療不產生應答，用藥實際就是一種浪費。
（3）藥源性肝損害有增無減。過度用藥的後果十分嚴重，我國藥物性肝損害的病例以每年3%—4．5%的速度增長。拉米夫定撤藥後肝炎已經成為一種新型肝炎的代名詞出現在教科書中，本來肝炎種類就夠多得了，現在由於使用拉米夫定不當而導致一種新的肝炎出現，可以說是得不償失。
