乙肝抗病毒治療是一個長期的過程，沒有捷徑可走。乙肝病毒很難被徹底根除，而乙肝病毒的持續復制是導致肝硬化、肝癌的罪魁禍首，所以，慢性乙肝抗病毒治療的總體目標是長期抑制乙肝病毒的復制，減少和防止肝硬化、肝癌及其並發症的發生。在治療過程中，患者應注意以下兩點———
1、慎選初治抗病毒藥物。
乙肝抗病毒治療需要患者做到長期規范用藥。在首選乙肝抗病毒治療藥物時，應盡量做到“三個減少”，即盡量減少患者經濟負擔，減少長期使用藥物的副作用，減少和防止肝硬化、肝癌及其並發症的發生。有調查顯示，目前僅有三成患者表示可堅持3年以上的抗病毒治療，而且很多患者因為經濟原因而停止治療。為了保證患者能堅持規范的抗病毒治療，醫生必須考慮到患者的經濟情況，在選擇初始治療方案時，盡量選擇那些患者能夠長期規范服用的藥物。有數據顯示，堅持長期抗病毒治療可大大降低肝硬化和肝癌的發生率。隨著抗病毒治療在臨床上得到廣泛的普及，國家也把某些抗病毒治療藥物納入醫保目錄，這為患者堅持長期治療提供了經濟保障。
2、在治療第6個月評估治療方案。
在接受初始治療後，患者應每隔三個月定期隨訪，並檢測HBVDNA等指標。而在治療後的第六個月評估治療方案是非常關鍵的，因為關系到評估初選的抗病毒治療方案是否有效果，是否需要調整方案。在治療的第六個月，如果發現血清中病毒DNA指標小於每毫升1000拷貝，則患者可繼續初始的治療方案，無需更換;如果該指標仍大於每毫升1000拷貝，說明藥物的效果並不理想。這時可通過調整方案，加用其他抗病毒治療藥物來提高療效，並且規避病毒變異的風險，解決耐藥問題。
