１.接種前已經被乙肝病毒感染。有的人由於在接種乙肝疫苗前沒有進行乙肝病毒學檢測，可能在接種前已經被乙肝病毒感染，當接種完乙肝疫苗後，發現HBsAg陽性，誤以為是由於接種疫苗導致的；還有的人注視前雖然進行了乙肝病毒學檢查，並且結果正常，但這也不能完全排除接種前已經感染了乙肝病毒的可能。因為如果檢查時正好處於病毒感染的潛伏期，大約半年左右，則檢查結果也可能出現“陰性”。
２.在機體沒有產生足夠的保護性抗體前不幸感染了乙肝病毒。注射乙肝疫苗後需要一定的時間才能產生足夠量的保護性抗體。一般情況下，在接種乙肝疫苗後感染的乙肝，多半是因為完成全程注射長達半年的時間裡，機體尚未產生抗體或產生抗體的水平較低，這時不幸感染了乙肝病毒；還有的人是未能按時完成全程免疫，即接種完三針，沒有產生保護性抗體而感染乙肝病毒。
也有少數人雖然完成了全程免疫，但由於免疫失敗，也可感染乙肝病毒，但這種情況比較少見。目前接種乙肝疫苗是預防乙肝的最佳方法。
哪些人群必須注射乙型肝炎病毒疫苗
處於HBV感染高度危險狀態的易感者(未感染過HBV的人)應接種乙肝疫苗。主要包括：
①全部新生兒及幼兒園未接種過乙肝疫苗的孩子；
②傳染科、口腔科、血液室、透析室和經常接觸血液的工作人員；
③新加入某一群體的人員，如新入伍的戰士、新入學的大學生；
④從事食品服務行業者及保育工作人員；
⑤發育障礙者，收容所中的患者和工作人員；
⑥血液透析患者；
⑦使用血液制品者；
⑧器官移植前的患者；需長期應用免疫抑制劑者；
⑨乙肝病毒攜帶者的家庭接觸者；
⑩注射毒品成瘾者；長期教養機構中的犯人。
