一、原發病的治療
病毒性肝炎，尤其是乙型肝炎在發展成肝硬化後，有的病毒仍在復制，在血液及肝組織中采用PCR檢測或原位雜交時檢測出病毒的RNA或DNA。所以仍有必要進行抗病毒治療。
抗病毒治療首先要了解患者的HBV是否處於復制狀態。只有在乙肝“2對半”中的HBsAg確實陽性，或HBeAg為陰性，但HBV-DNA仍為陽性者，說明HBV在復制，可進行抗病毒治療。近年來，國內開展了HBV-DNA的定量檢測，發現目前較為常用的斑點雜交不夠敏感，不少斑點雜交結果為陰性者，定量檢測證明病毒仍在復制。故在斑點雜交的敏感性未提高前，對HbeAg已陰轉，但肝功能仍不正常者，應該用定量方法檢測，確定病毒是否復制．是否進行抗病毒治療。目前所有的抗HBV有效藥物或綜合措施，只能使其復制指體陰轉，也就是HBeAg和HBV-DNA陰轉，對HBsAg均無明顯作用。所以，經過治療復制指標陰轉即為有效。市面上有些藥物宣傳，所謂能使HbsAg轉陰轉率高達百分之幾十，都是沒有科學資料和依據的，當然不可信。醫務人員應對患者耐心解釋說明，使患者掌握這方面的常識．以免亂服藥．白花錢。
目前國外、國內公認有效的藥物有以下幾種：
1．干擾素（IFN）
用於慢性乙型肝炎的干擾素．主要是a干擾素。a干擾素治療慢性乙型肝炎已有20多年，基本有了共識：
（1）a干擾素治療慢性乙型肝炎是一種有效的藥物，但療效不滿意。持久有效率（指停藥後隨訪1年；血清HBV-DNA和HbeAg的陰轉率約20％～40％）。
（2）a干擾素的抗HBV作用，主要是抑制HBV復制，表現為血清HBeAg及HBV-DNA陰轉，難以清除HBV，因此，治療後復發率較高。
（3）國內的經驗是各種干擾素之間療效沒有差異，國產的和進口的，a2a和a2b等療效相仿，可根據患者的經濟承受能力選用。
（4）IFN治療有一些副作用，早期有類似流感樣症狀，後期可出現乏力、抑郁症、骨髓抑制以及某些自身免疫性疾病。IFN治療費用昂貴，使用受到限制。
2．核苷類似物
現在我國上市的為葛蘭素威康公司生產的賀普丁。這是具有強大抑制病毒復制作用的新一代核苷藥物。有實驗證明拉米夫定對肝硬化合並活動性病毒復制有肯定作用，有利於延緩甚至逆轉肝纖維化、肝硬化的進程，只是療程上可要更長一些。
由於核苷類似物抗病毒作用強，不良反應少，可以口服，使用方便，化學結構簡單可以人工合成等優點，成為抗病毒藥物研究領域中的熱門課題。對HIV、HBV、HCV、瘡疹病毒等均有明顯抑制作用。用於抗 HBV的新的核省類似物，主要有拉米夫定（IWhivudine，正式上市）、泛昔洛韋（Famciclovic，Ⅲ期臨床試驗）、洛布卡韋（lobucavir）、阿地福韋（ade－forir）及 FTC（二膜氧氟硫代胸嘧啶）均進行期臨床試驗。FMAU（氟用阿糖尿嘧啶）及FDDC（氧二脫氧胸嘧啶）正在作Ⅰ期臨床試驗。BMS200475（環氧羟碳脫氧鳥苷）正在作臨床前研究。
3．免疫調節劑：八八乙肝泰；人胎肝細胞生長因子；胸腺肽al；核酸疫苗；過繼細胞免疫。
4．聯合用藥
抗病毒藥物聯合治療可能提高療效。常用的聯合治療采用a干擾素聯合免疫調節劑，如胸腺素al（日達仙）、胸腺肽、左旋咪唑塗布劑、乙肝疫苗等。亦可采用干擾素聯合其他抗病毒藥，如拉米夫定等。但聯合治療對慢性乙型肝炎的療效，尚需進一步進行科學的臨床驗證。
二、對症治療
目前尚無特效藥物治療，不宜濫用藥物，否則將加重肝髒負擔適得其反。
1、補充多種維生素 維生素C、E、及B族有改善肝細胞代謝、防止或減輕脂肪變性和保護細胞的作用。同是可酌情補充維生素K、B12和葉酸。
2、保護肝細胞的藥物 肌苷是細胞激活劑，可提高三磷酸腺昔的水平，並可轉變為其他核苷酸。
3、降酶退黃藥物 種類繁多，療效差異不大。可選用聯苯雙酯、甘利欣或甘草甜素、門冬氨酸鉀美、熊去養膽酸以及含有五味子、垂盆草、水飛薊等成分的中藥制劑。
4、提高血漿清蛋白 最有效的方法是輸注清蛋白。清蛋白的半衰期為17～21天，在臨床使用時應注意劑量及間隔時間，如每周使用l～2次，則難以提高患者的清蛋白水平。在使用清蛋白的治療期間，可交替使用新鮮血漿。既往曾有使用烏雞白風丸、復方當歸片等方法的報道，但在臨床使用中，療效並不明顯。
5、改善疲勞症狀 哌甲酯可改善肝炎後肝硬化患者的中度及重度慢性疲勞症狀。每日口服哌甲酯10-20mg，1天1次或2次，連續服用5天後停藥2天。中位治療時間為6個月。
三、並發症的治療
肝硬化的並發症如腹水、食管靜脈曲張出血、肝性腦病、肝腎綜合征、自發性腹膜炎等。
