1. 長期、規范
大家都知道乙肝病毒很難被徹底消滅。無論是干擾素還是核苷酸類似物都只能抑制乙肝病毒的復制，短期治療(≤1年)停藥後，患者的HBV DNA水平都會出現大幅度反彈，這就證明了乙肝治療需要“長治”才能“久安”;在做到長期治療的同時，規范用藥也不容忽視。不遵從醫囑、擅自停藥或換藥很可能會造成病情惡化，最終造成療效不佳，甚至耐藥，導致疾病進展。因此，大家在治療期間一定要做到長期用藥、規范用藥。
2. 費用
由於抗病毒治療是一個長期過程，因此治療的費用也是我們在選擇藥物時要考慮的重要因素。俗話說：“不買貴的，只選對的。”不一定貴藥就是最好的藥或最適合的藥。目前國內批准上市的4種口服抗病毒藥物拉米夫定、替比夫定、阿德福韋酯和恩替卡韋都可以有效抑制乙肝病毒復制，但價格上相差較大。這四個藥物的月花費是：拉米夫定(賀普丁)430元左右，阿德福韋酯(賀維力)590元左右，替比夫定(素比伏)750元左右，恩替卡韋(博路定)1200元左右。我國慢性乙肝患者月收入在3000元以下的有70%以上，因此選擇自己能承擔的藥物堅持長期治療依然是乙肝患者首要考慮因素。乙肝治療不能速戰速決，如果在治療初期選擇價格昂貴的藥物，而在治療中期卻由於經濟負擔過重而自行停藥或換藥，則會帶來嚴重的後果——治療失敗從而使疾病進展。所以，慢性乙肝患者應該選擇物美價廉的抗病毒藥物，既保證療效，又能在經濟上負擔得起長期抗病毒治療。
3. 療效
判斷抗病毒治療的療效要看它是否能夠減少肝硬化和肝癌的發生，目前的4種口服抗病毒藥物在抑制乙肝病毒復制和e抗原轉陰上的效果都不錯，但只有拉米夫定有超過10年的延緩疾病進展、減少肝硬化使肝癌發生的臨床數據。研究顯示拉米夫定抗病毒治療3年能夠使肝硬化的發生率降低55%，肝癌的發生率降低51%;拉米夫定10年隨訪數據證實：75%的肝纖維化患者達到了組織學改善，其中18.8%患者的肝纖維化被完全逆轉。可見，只有長期治療療效好的藥物才能使患者最大程度的獲益。患者在選擇抗病毒藥物時更需關注長期的治療效果。
4. 副作用
因應用核苷(酸)類似物的乙型肝炎患者須接受長期治療，甚至終身治療。該類藥物引起的不良反應亦受到廣泛關注。動物實驗中的致實體瘤的風險困擾著醫生和患者。而應用核苷(酸)類似物引起的不良反應的文獻報道如肌病、腎毒性、周圍神經病、乳酸酸中毒等更是關注的焦點。這些由藥物引起的副作用一旦出現卻沒有及時采取措施，很有可能危及生命。因此，高度重視口服抗病毒藥物的安全性，定期檢測CK等指標，對堅持長期治療起著積極的作用。比較4種口服抗病毒藥物，其中拉米夫定已上市十年，是用於治療慢乙肝的口服抗病毒類藥物中上市最早的藥物，適用人群最廣，安全性好。
5. 定期檢測
臨床試驗數據表明，HBV DNA水平是預測療效的重要指標。因此，乙肝患者在抗病毒治療過程中要堅持定期監測，尤其是在半年(24周)這個關鍵時間節點。以拉米夫定為例，如果治療半年時，HBVDNA轉陰，說明療效很好，可以繼續單藥治療。一旦發現HBV DNA大於10 3拷貝/ml，加用無交叉耐藥的藥物(阿德福韋酯)聯合治療療效更好。研究顯示，132例拉米夫定耐藥的患者加用阿德福韋治療3年後， 87%患者HBV DNA轉陰，32%的患者出現e抗原血清轉換，而耐藥率僅1.6%。另一項研究顯示：拉米夫定耐藥的患者改用每日2片恩替卡韋治療，5年有近一半的患者還會發生耐藥，因此，2010年中國指南指出：發現療效不佳，應該加藥而不是換藥。
其次是藥物副作用的監測。由於慢性乙肝的治療是長期的，藥物引起的副作用也越來越多的受到關注。定期監測很重要(如血CK值、腎功能等)，發現問題及時處理。
乙肝患者其他的檢測還包括：乙肝五項、肝功能、B超和肝穿(肝穿刺活組織)等，對判定療效和疾病進展都很有幫助。
